ニホンアマガエルとシュレーゲルアオガエル，モリアオガエルはよく混同されるが次のような特徴から見分けることができる（このページの写真はクリックすると拡大します）． ニホンアマガエルは鼻腔から目を通り鼓膜にかけて黒い模様がある．周囲の環境の色によって緑色から茶色に変化することができ，茶色くなると背中に雲状の模様が現れる．アオガエル2種に比べ鼻先に丸みがある． シュレーゲルアオガエルの体色はたいてい緑色で，土に潜っている時などは赤褐色に体色変化している．背中に模様はない．顔にアマガエルのような模様はなく，また，虹彩の色が金色であることでモリアオガエルと見分ける． モリアオガエルの体色は一般的に緑色である．シュレーゲルアオガエル同様，顔に模様はない．集団によっては背中に赤褐色の模様がある．虹彩の色が赤いことでシュレーゲルアオガエルと見分ける．またシュレーゲルアオガエルより大型である． 全体像