「複雑ネットワーク」とは何か: DESIGN IT! w/LOVE
不確実な時代をクネクネ蛇行しながら道を切りひらく非線形型ブログ。人間の思考の形の変遷を探求することをライフワークに。 「複雑ネットワーク」とは何か It's a small world ! 思ったよりも世界は狭い。 1998年、コーネル大学の２人の数学者、ダンカン・ワッツとスティーブン・ストロガッツが発表した論文「『スモールワールド･ネットワーク』における集団力学」を皮切りに、ネットワーク科学は、多くの科学者をはじめ、一般の人にも注目を集めるようになりました。 「セグメンテーションとノード間の隔たり」のエントリーでは、マーク・ブキャナンの『複雑な世界、単純な法則』を紹介しましたが、『「複雑ネットワーク」とは何か―複雑な関係を読み解く新しいアプローチ』は、そんなネットワーク科学の概要を非常にわかりやすくまとめている本で、ネットワーク科学って何？って思っている人にはうってつけの入門書だと思いま
Pajek入門 －巨大ネットワーク分析用フリーソフトウェア－: それゆけBioinformatics
Pajek official site Developed by Vladimir Batagelj and Andrej Mrvar at the University of Ljubljana, Slovenia. 1. Pajek概要 Pajekは、フリーのWindows (32 bit)用の巨大なネットワーク分析プログラムである。 Yeast two-hybrid (Y2H)法によるタンパク質－タンパク質相互作用ネットワークのような大量データ(多数のタンパク質がある)をネットワーク分析する際に、行列表示に基づく標準的なネットワーク分析ツールで効率的に扱うことは非常に困難である。大量なネットワークデータに対してPajekが出来ること・目指すゴールは以下の通りである。 (1) 巨大なネットワークを小さなネットワークへと分離・抽出する (2) ユーザにネットワークの強力な視覚化ツールを提
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