アニメは「DRIFTERS」「ジョジョの奇妙な冒険」などを手がけた鈴木健一が監督。シリーズ構成は「月がきれい」「ちはやふる」の柿原優子、キャラクターデザインは「おおきく振りかぶって」「弱虫ペダル」の吉田隆彦、音楽は「逃げるは恥だが役に立つ」の末廣健一郎・MAYUKOが務める。アニメーション制作は、2017年7月に公開された本作のスペシャルアニメ映像も制作を担当したdavid productionが引き続き行う。 また公式サイトでは、アニメ化発表を行うPVを公開中。そのほか特設応募フォームから送られてきた依頼に細胞たちが応える「リアルはたらく企画」や、日本調剤株式会社監修による「オリジナルおくすり手帳」のプレゼント企画も用意されている。「オリジナルおくすり手帳」の当選者数は抽選30名で、応募期間は2月2日まで。 「はたらく細胞」は、人間1人あたり約60兆個あるという細胞を擬人化したマンガ。月
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