Ubuntu/Linuxのお勉強と科学技術計算をメインに…Gromacsのインストール。今回は簡潔にメモ書き。 シリアル版 展開してディレクトリ移動 tar xvzf gromacs-4.0.7.tar.gz cd gromacs-4.0.7 コンフィグ 以下を一文で実行する。 ./configure CC=icc CXX=icpc CFLAGS="-O2 -msse2" \ --prefix=/opt/intel --enable-sse --with-fft=fftw3 \ CPPFLAGS="-I/usr/include -I/opt/intel/include" \ LDFLAGS="-L/usr/lib -L/opt/intel/lib -lmkl_intel \ -lmkl_intel_thread -lmkl_core -lifcore -lguide \ -lpthread