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bioとaffymetrixに関するisominoのブックマーク (1)

  • KnobBook - KNOB Wiki (ja)

    FrontPage 遺伝子配列の取得 † KNOBで遺伝子配列を得るにはEMBOSSを利用します。ほかにもBioRubyやBioPerlを使った方法がありますが、EMBOSSを使えばプログラミングせずに簡単に様々なデータベースから配列を取得することができます。 ↑ EMBOSSとは † EMBOSSは150以上の配列解析プログラムを集めたものです。配列を切り出したり、相補鎖を出力したりするような基的な配列の編集だけでなく、配列アラインメント、高速なデータベース検索、モチーフ検索、リピートの同定、コドン解析, プライマー/プローブ/RNAi設計など様々なアルゴリズムが実装されています。 EMBOSSの素晴らしい点は、これらのプログラムが自由に使えることです。まず、EMBOSSは無料ですので、高いライセンス料を払う必要がありません。もっと重要なことは、プログラムのソースが公開されているという

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