scRNA-seqデータの統合について 今回はseuratのハンズオンの中にあるこちらの記事について解説していこうと思います。 scRNA-seqデータの統合 2つ以上のシングルセルデータセットを統合して分析する方法がSeurat によって提供されています。 例えば、以下の図のようにデータ統合を行うことで、コントロール（CTRL）と刺激（STIM）がほぼ一致するようなUMAPが描かれていることが分かるかと思います。 この統合されたサンプルを使えば、各遺伝子でコントロールに比べ発現が上昇した遺伝子（下図は、IFI6の例）を確認することができます。 https://satijalab.org/seurat/articles/integration_introduction より一部改変して引用 アンカーとは？ アンカーとは、異なるシングルセルRNAシーケンス（scRNA-seq）データセット間

Single Cell RNA-seqデータのQCには様々なパターンがありますが、その中の一つにダブレット検出があります。 本記事では、DoubletFinderというダブレット検出ツールを用いて、scRNA-seqデータからダブレットを検出してみようと思います。 ダブレットを検出できるようになれば、scRNA-seqデータ解析でより信頼性が増します。是非やってみましょう。