多次元尺度法で遊んでみる（オレ流 R入門） - ダウンロードたけし（寅年）の日記多次元データをクラスタリングする際に、それらのデータを2次元データに落とし込んで可視化させたいことがあります。そんな時に便利なのが「多次元尺度法」という手法です。 個々のデータ間の距離／類似度が分かっている場合に、それらのデータの座標を求めて、データ構造を復元するようなものです。 詳しい説明は割愛します。知りたい人はwikipediaと金先生の連載を読んで下さい。 体で覚えるタイプなので、とにかく何かデータを処理してみます。 「山手線」の地図を再現 さっそく試してみます。 山手線の各駅同士の直線距離を測っておいて、そのデータから実際の位置関係を復元できるか実験してみます。 山手線全駅の距離を測るのはめんどいので、適当に抜粋してしらべました。 以下のような表になりました。単位はメートルです。 さてさて、この距離表からどのようなデータ構造が再現されるでしょうか？ このデータを統計解析ソフトRで
