ファージゲノムのORFを予測する PHANOTATE - macでインフォマティクス2019 5/30 タイトル修正、関連ツール追加 バクテリアに感染するウイルスであるファージは、バイオインフォマティクスに独自の課題をもたらす。どのくらいの量のDNAをキャプシドにパッケージングすることができるかには限界があり、したがってファージゲノムは一般に短く、典型的には20〜100kbの範囲である。 必然的に、それらのゲノムはコンパクトである：ファージ遺伝子はそれらの細菌ホモログより短く、しばしば同時に転写され、そして隣接するオープンリーディングフレームはしばしば重なり合う（Kang et al、2017）。いくつかの場合では、ファージ遺伝子は互いにコードされている（Cahill et al、2017; Summer et al、2007）。対照的に、細菌遺伝子は一般に長く、遺伝子間スペーサーによって分離され、そして鎖を頻繁に交換する（Kang et al、2017）。ファージゲノム
https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkz342/5486273
