cytoscapeの検索結果1 - 3 件 / 3件

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  【ネットワーク解析】CytoscapeのstringAppを使って、タンパク質間相互作用ネットワーク解析を行う【Cytoscape】 - LabCode

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  • labo-code.com
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  • 2024/01/15

  タンパク質間相互作用ネットワーク解析とは？ タンパク質間相互作用ネットワーク解析（Protein-Protein Interaction Network Analysis）は、タンパク質同士がどのように相互作用し、生物学的プロセスやシグナル伝達経路に関与するかを研究する方法です。この解析は、細胞内のタンパク質が形成する複雑なネットワークを理解するために使用されます。 ネットワークの構築: 同定された相互作用を基に、タンパク質間の関係を示すネットワークを構築します。このネットワークは、ノード（タンパク質）とエッジ（相互作用）で構成されます。 データの解析と解釈: 構築されたネットワークを分析して、重要なタンパク質、相互作用のハブ、機能的なクラスターなどを同定します。これには、ネットワークトポロジーの解析や機能的注釈などが含まれます。 PPIは、細胞の振る舞いや疾患のメカニズムを理解するための
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  【RNA-seq】Cytoscapeの使い方【ネットワーク解析】 - LabCode

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  • 2024/01/15

  Cytoscapeの魅力の一つは、その豊富なプラグイン（アプリとも呼ばれる）です。これらのプラグインは、ユーザーが特定の分析やビジュアライゼーションのニーズに合わせてCytoscapeの機能を拡張することを可能にします。 Cytoscapeのプラグインリストは、Cytoscape App Store（http://apps.cytoscape.org/）で確認でき、Cytoscape開発チームによって知られているすべての公開プラグインがリストアップされています。 今回は遺伝子発現データの可視化、ネットワーク解析、および生物学的経路の探索を助ける代表的なプラグインを解説したいと思います。 Cytoscapeをインストールする まずはCytoscapeをインストールしていきましょう。以下のサイトにアクセスしてダウンロードしてください。 https://cytoscape.org/ ダウンロード
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  Cytoscape.jsを試してみた - Qiita

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  • qiita.com/madilloar
  • テクノロジー
  • 2019/07/13

  Cytoscape.jsとは Cytoscape.js(http://js.cytoscape.org/): グラフ理論（ネットワーク）の可視化と解析のためのライブラリです。ライセンスは MIT License なので、商用にも使えます。下記デモで利用している依存ライブラリもMIT Licenseです。 次のURLをクリックすると、デモ用ページに遷移します。 Cytoscape.js demo(https://madilloar.github.io/pub-pages/cytoscape1.html) 使い方: 「Layout:」コンボボックスで、レイアウトを選択すると、グラフのノード配置が変わります。 「読込」ボタンは、その右にあるテキストエリアに書いてあるノードとエッヂの情報に従って、ノードのグラフを書きます。 「保存」ボタンは、その右にあるテキストエリアに、現在のグラフにあるノードの

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