オントロジーエディタprotégéを使う | Find Something You’ve Lost
2013年10月8日に行われた第7回LinkedData勉強会にて「オントロジーエディタprotégéを使う」と題してprotégéの使い方を簡単に紹介しました。時間がおしていたことなどから非常に駆け足の説明となり、分かりにくい点が多々あったと思います。その後、スライドを見るだけでもなるべく分かるようにするために若干加筆修正をしてslideshareにアップしました。 protégé全体の説明を詳細にすることは困難なので、ひとまず、起動して何をしていいのか分からない、という状況にならないような紹介にしようと思いました。非常に簡単な事例を除いて、最初から思い描いていた通りのオントロジーを構築することはほぼ無理なので、実際の作業としては、オントロジーを作る → それを利用したデータセットを構築する → アプリケーションなどから利用する → 問題を見つける → オントロジーを更新する、の繰り返し
Protege4Pizzas10Minutes - Protege Wiki
Pizzas in 10 Minutes A Quick Demonstration of Handy Shortcuts and Features for Protege 4,5 and newer. by Alan Rector Introduction Protégé is a powerful editing environment with many features. So many features that many users have not found most of them. This is a quick trip through how to build our standard Pizza ontology in 10 minutes or less of actual typing. If you have any problems with this w
rdfizing-db-guidelines/dbcls-rdfizing-db-guidelines-ja.md at master · dbcls/rdfizing-db-guidelines · GitHub
RDFは、曖昧性が少なく、機械可読性の高いデータを記述する枠組みです。しかし、実際に記述したいデータをどのようにRDF化すれば、表現したい内容が記述できるのか、また、その後の利用の観点からより良いものになるのか、という指針は提供されていません。このことが、データベースをRDF化する際に、特に初心者にとって高いハードルとなっています。幸い、これまで BioHackathon や SPARQLthon などでも、様々な議論がなされ、知見も蓄積されてきました。そろそろこのコミュニティでデータをRDF化する際に指針となるようなガイドラインを作る時期にきたと思います。本ガイドラインが目指すのは、それを参照することで、RDF化作業の負担が減り、また他のデータと適切に統合して利用できるようなRDFを作成できるようにすることです。 基本精神として、Tim Berners-Leeによる、 Linked Da
RDF Translator
License and Source Code The source code of this tool is available under a LPGL license from here. This service is built on top of RDFLib 5.0.0, an RDF library which allows to parse and serialize between data formats. Furthermore, it is using pyRdfa for RDFa 1.1 parsing, pyMicrodata for Microdata parsing, and rdflib-jsonld for parsing and serializing JSON-LD. For the conversion to RDFa and Microdat
Open Graph protocol
Introduction The Open Graph protocol enables any web page to become a rich object in a social graph. For instance, this is used on Facebook to allow any web page to have the same functionality as any other object on Facebook. While many different technologies and schemas exist and could be combined together, there isn't a single technology which provides enough information to richly represent any
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FDAcategoryD - Schema.org Enumeration Member
MeSH Linked Data
How to build a RDF dataset in Protégé
【RDFポータル】過去URLでのアクセスを終了しました (新URLをご利用ください) - NBDC
GitHub - dbcls/rdfizing-db-guidelines: DBCLS RDFizing database guidelines
NCBO BioPortal
premature death Mammalian Phenotype Term (MP:0002083)
http://www.ebi.ac.uk/rdf/sites/ebi.ac.uk.rdf/files/images/atlas/ExpressionAtlasSimpleSchema.jpg
Google Code Archive - Long-term storage for Google Code Project Hosting.
http://togows.org/entry/pubmed/20472643.ttl
都道府県健康・栄養調査結果
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4015691/pdf/2041-1480-5-14.pdf
Sample Queries
NCBI2RDF: Enabling Full RDF-Based Access to NCBI Databases
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