http://nano.cc.toin.ac.jp/~ysd/semi/gromacs.txtGROMACS MD計算の手順 http://www.nanolc.jst.go.jp/~yoneya/funcPhysChem/MDflow.html の補足． コマンドのデフォルト入出力ファイル名 デフォルト名の場合は optionalでないオプション指定（-f 等）は省略可能で， カレントホルダー，share/top/の順に捜される． デフォルトファイル名以外を使用する時は拡張子でファイル形式を指定でき， 拡張子を省略した時はデフォルト拡張子が補われる． grompp: 構造ファイル，力場ファイル，MDパラメータファイルを読んでMD入力tprファイルを作成． -f grompp.mdp Input, Opt. grompp input file with MD parameters -po mdout.mdp Output grompp input file with MD par
GROMACS - Gromacs
GROMACS - Gromacs
