【GROMACS】Umbrella samplingによるMD simulation 【In silico創薬】【SMD】 - LabCode
Umbrella Samplingの概要と目的Umbrella Samplingは、分子がめったに起こさないような状態変化（たとえば、タンパク質同士が離れるなど）を詳しく調べるための計算手法です。通常の分子動力学（MD）では、エネルギー的に安定な状態にとどまりやすく、重要な変化が起こる確率が低いため、十分な情報が得られません。 たとえば、タンパク質AとBがくっついている状態から、少しずつ離れていく様子を観察したいとき、まずAとBを少しずつ引き離すSteered Molecular Dynamics（SMD）などのシミュレーションで、さまざまな距離の構造を取得します。その中から、0.5nm、0.7nm、0.9nmなど、特定の距離ごとに「窓（window）」を設定し、それぞれの距離でバネのような力をかけてMDシミュレーションを行います。これにより、その距離での分子の振る舞いをしっかり観察できま
Metashapeで全天球画像をキューブマップに変換
Metashapeは全天球画像(エクイレクタングラー)の処理に対応していますが、アライメント結果を他のSfM系ソフトで利用する場合は、全天球画像のままでは渡すことが出来ません。 postshot、RealityCapture、Inria 3D Gaussian Splatting等は全天球画像には対応していないためです。 しかし先日smert999氏が「Agisoft_metashape_convert_to_cubemap」を公開されました！ Metashapeでアライメントした全天球画像を、そのアライメント結果を維持したままキューブマップに変換できるというものです。 Theta, Insta360等で360度動画/全天球画像撮影 → Metashapeでアライメント → キューブマップ変換 → RealityCaptureで活用・postshotで3DGS生成 といったワークフローが可
GitHub - ComfyUI-Workflow/awesome-comfyui: A collection of awesome custom nodes for ComfyUI
ComfyUI-Gemini_Flash_2.0_Exp (⭐+172): A ComfyUI custom node that integrates Google's Gemini Flash 2.0 Experimental model, enabling multimodal analysis of text, images, video frames, and audio directly within ComfyUI workflows. ComfyUI-ACE_Plus (⭐+115): Custom nodes for various visual generation and editing tasks using ACE_Plus FFT Model. ComfyUI-Manager (⭐+113): ComfyUI-Manager itself is also a cu
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