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2011年11月23日のブックマーク (2件)

  • Next Generation Sequencer wiki - IGVチュートリアル

    バイナリのダウンロード バイナリをダウンロードしての作業を想定。 ユーザー登録を済ませ、ログインしたら下記のダウンロードページに飛ぶことができるので、 赤丸をクリックして適当なところにダウンロードする zipの解凍と実行 解凍するとIGV_1.5.xxのようなフォルダができるので、 このフォルダごと任意の場所にコピーまたは移動する。 windowsの場合は、\IGV_1.5.xx\igv_win.batを実行するとIGVが起動する。 参照配列のインポート hg18やmm9などの主要なゲノム配列は最初から用意されているが、 用意されていないゲノムはfastaファイルをインポートしないといけない。 チュートリアルでは酒類総合研究所のAspergillus oryzae RIB 40 genome DB から fasta配列をダウンロードして読み込んでみる。 配列への直リンク

  • NGS Surfer's Wiki | SAMtools

    概要 SAM,BAMフォーマットのマッピング結果ファイル等を操作するプログラム集です。 多型解析方面が特に力が入っています。 プログラムリスト Version0.1.18の場合

    soh3914
    soh3914 2011/11/23