2つのサンプル間の比較なら2色法、2つ以上のサンプル間の比較(例えば時系列)なら1色法を用います。 実験を開始する前の一般的な注意点: 統計学の専門家からすると、実験をした後ではなく実験をする前に相談してくれということらしいです(後から相談されても、なぜその実験が死んでしまったかを報告できるだけだとFisherが言っています)。腫瘍細胞株のように全く同じサンプルが得られない場合(臨床サンプルや初代培養系など)、予めtriplicateや時系列実験に必要な細胞数を確保して置く必要があります。似ている細胞でも由来が異なると遺伝子の発現パターンがかなり違うと言われています。全てのアレイ実験を一度に行う必要はないので、RNAまで抽出し保存しておくと安心です。 プローブ標識とハイブリダイゼーション: マニュアルに従います。 スキャン(Scan Control Software): アレイをスキャンし
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