Exploring the tidyHeatmap R package – Thomas Sandmann’s blog
tl;dr This week I learned about the tidyHeatmap package, which wraps the functionality of the awesome ComplexHeatmap R package into functions with a tidyverse interface. No more need for pivoting tidy datasets into matrices and back! Installing the tidyHeatmap R package The tidyHeatmap R package is available from CRAN 1. The latest release available from CRAN can be installed via:
patchworkを使って複数のggplotを組み合わせる - Qiita
以下の文章はpatchworkパッケージ(thomasp85/patchwork: The Composer of ggplots)のREADMEの翻訳に少し解説を追加したものです。 patchwork patchworkはggplot2により作成された複数のプロットをめちゃ簡単に組み合わせられるようにすることを目標として開発されているパッケージだ。 同様の目的のパッケージ、関数として、gridExtra::grid.arrange()やcowplot::plot_grid()があるが、これらで上手くやろうとすると試行錯誤が結構必要となる。 これに対し、patchworkでは演算子を使った直感的な記法でプロットを組み合わせられるので、より簡単で可読性に優れた記述が可能となる。 インストール 現在はCRANからインストールできる。
A Toolbox for Manipulating and Assessing Colors and Palettes
Developers Ross Ihaka Author Paul Murrell Author Kurt Hornik Author Jason C. Fisher Author Reto Stauffer Author Claus O. Wilke Author Claire D. McWhite Author Achim Zeileis Author, maintainer Developed by Ross Ihaka, Paul Murrell, Kurt Hornik, Jason C. Fisher, Reto Stauffer, Claus O. Wilke, Claire D. McWhite, Achim Zeileis.
How to expand color palette with ggplot and RColorBrewer
Histograms and bar charts are almost always a part of data analysis presentation. If it is made with R ggplot package functions geom_histogram() or geom_bar() then bar chart may look like this: The elegance of ggplot functions realizes in simple yet compact expression of visualization formula while hiding many options assumed by default. Hiding doesn't mean lacking as most options are just a step
Introduction to cowplot
The cowplot package is a simple add-on to ggplot. It provides various features that help with creating publication-quality figures, such as a set of themes, functions to align plots and arrange them into complex compound figures, and functions that make it easy to annotate plots and or mix plots with images. The package was originally written for internal use in my lab, to provide my students and
『心理学研究』に準拠したggplot2のtheme - はやしのブログ Rev.3
息抜きにRzThemeEditorで作ってみたら，息抜きにならないぐらい一瞬でした。 ggplot2のテーマを手軽に作成・編集する（R Advent Calendar 2012） - はやしのブログ Rev.3 せっかくなので公開しておきます。 「執筆・投稿の手引き」を見て作りましたが，正しさに責任は持ちません。 こんな感じです。 p <- ggplot(data = iris, aes(x = Sepal.Length, y = Sepal.Width, colour = Species)) p <- p + geom_point() p <- p + scale_colour_grey() p <- p + theme_JPR() print(p)
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GitHub - dzhang32/ggtranscript: Visualizing transcript structure and annotation using ggplot2
Set Axis Break for ggplot2
Sina plot — geom_sina
GitHub - corybrunson/ggalluvial: ggplot2 extension for alluvial plots
GitHub - robjohnnoble/ggmuller: Create Muller Plots of Evolutionary Dynamics
Tyler Morgan-Wall - Introducing 3D ggplots with rayshader
Create Maps and Visualize Data in 2D and 3D
GitHub - AckerDWM/gg3D: A ggplot2 extension enabling 3D projections
11 Colour scales and legends | ggplot2
http://www.ggtern.com/d/2.2.0/
2d density plot with ggplot2
GitHub - kassambara/rstatix: Pipe-friendly Framework for Basic Statistical Tests in R
GitHub & BitBucket HTML Preview
Extension to ggplot2