[プログラミング] ビット並列アルゴリズムを使った編集距離 - tsubosakaの日記
ふと、ビット並列アルゴリズムを使った編集距離を計算するアルゴリズムを書きたくなったので書いてみた。 まず、通常の編集距離であるLevenshtein Distanceを求めるアルゴリズムは以下のように書ける int levenshteinDistance(String A, String B) { int m = A.length(); int n = B.length(); int dp[] = new int[n + 1]; int next[] = new int[n + 1]; for (int i = 0; i <= n; i++) dp[i] = i; for (int i = 1; i <= m; i++) { next[0] = i; for (int j = 1; j <= n; j++) { if (A.charAt(i - 1) == B.charAt(j - 1))
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Scala による diff の実装：Rainy Day Codings：So-net blog
「Scala で diff を書いてみた」[1] という記事に触発されて [2] の論文や [3] の解説を読んで diff のアルゴリズムを勉強して自分なりに Scala で実装してみました。 これは [2] で "An O((M+N)D) Greedy Algorithm" と呼ばれているほうの実装で、論文の後半では改良についても書いてあるけどそちらは読んでいません。 私なりに工夫をした部分は全体的に副作用を排除した所とエディットグラフの格子点をオブジェクトとして表現した点です。 元論文の擬似コードで "a number of simple optimizations are employed" とされている部分は可読性の観点から取り入れませんでした。ただ元論文が「D回の編集で到達する（対角線 k 毎の）最遠点の集合」を配列で管理しているのを Set で管理するようにしたのは本当はよろ
文書比較（diff）アルゴリズム
文書比較（diff）アルゴリズム 前のドキュメント 次のドキュメント ＶｉＶｉの文書比較（diff）機能で使用しているアルゴリズムについて解説する。 これらのアルゴリズムは Myers 氏らの論文によるもので、氏は筆者のためにわざわざ論文をＷｅｂサイトで入手可能な形式にしてくださった。この場を借りてお礼申し上げる。 オリジナル論文は以下のＷｅｂサイトから入手可能である。 http://www.cs.arizona.edu/people/gene [1] E.W.Myers, "An O(ND) Difference Algorithm and Its Variations", Algorithmica, 1 (1986), pp.251-266 [2] S. Wu, U. Manber, G. Myers and W. Miller, "An O(NP) Sequence Comparis
Longest Common Subsequences
ICS 161: Design and Analysis of Algorithms Lecture notes for February 29, 1996 In this lecture we examine another string matching problem, of finding the longest common subsequence of two strings. This is a good example of the technique of dynamic programming, which is the following very simple idea: start with a recursive algorithm for the problem, which may be inefficient because it calls itself
Algorithm::Diff - 2つのファイル/リスト間での'気の利いた'差異を求めます。 - perldoc.jp
名前¶ Algorithm::Diff - 2つのファイル/リスト間での'気の利いた'差異を求めます。 概要¶ use Algorithm::Diff qw(diff sdiff LCS traverse_sequences traverse_balanced); @lcs = LCS( \@seq1, \@seq2 ); @lcs = LCS( \@seq1, \@seq2, $key_generation_function ); $lcsref = LCS( \@seq1, \@seq2 ); $lcsref = LCS( \@seq1, \@seq2, $key_generation_function ); @diffs = diff( \@seq1, \@seq2 ); @diffs = diff( \@seq1, \@seq2, $key_generation_function
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Diff
Bit-String Longest Common Subsequence LCS Algorithm
http://www.eecs.berkeley.edu/~gene/
computer programming II