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検索とDATABASEに関するtk60qtのブックマーク (1)

  • FASTAとBLASTについて

    NCBIでは、BLASTというFASTAのほぼ50倍速い、ホモロジー検索サービスが提供されます。これは、電子メールによるサーバーで、e-mailで検索配列を送るとe-mailで結果がもらえるというものです。また、これらのクローンサービスマシンが日にも置かれるようです。 さて、BLASTは、Basic Local Alignment Search Toolの略で、NCBIにはBLASTのコーディングをしたWarren Gishがいます。以下のFASTAとBLASTの違いの話は彼に聞いた話です。 (註)現在、遺伝研(DDBJ)では、FASTA のサービスは Web、E-mail では提供しておりません(検索・解析サービスの一部終了のお知らせ)。FASTA をご利用の場合には、遺伝研スーパーコンピュータシステムをご利用ください。 遺伝研では現在FASTAというホモロジーサーチのプログラムが動い

    tk60qt
    tk60qt 2015/09/07
    執筆日はいつなんだろう?"遺伝研では現在FASTAというホモロジーサーチのプログラムが動いていますが、これとBLASTを比較ししたいと思います。"
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