1000 Genomes | A Deep Catalog of Human Genetic Variation
The International Genome Sample Resource The 1000 Genomes Project created a catalogue of common human genetic variation, using openly consented samples from people who declared themselves to be healthy. The reference data resources generated by the project remain heavily used by the biomedical science community. The International Genome Sample Resource (IGSR) maintains and shares the human genetic
69 Genomes Data - Complete Genomics
A diverse data set of whole human genomes are freely available for public use to enhance any genomic study or evaluate Complete Genomics data results and file formats. These include 69 DNA samples sequenced using our Standard Sequencing Service, which includes whole genome sequencing, mapping of the resulting reads to a human reference genome, comprehensive detection of variations, scoring, and in
UC San Diego Health Newsroom
During open enrollment, choose San Diego's best health care. Get started.
Introduction to Circos, Features and Uses // CIRCOS Circular Genome Data Visualization
What is Circos? Circular visualization Circos is a software package for visualizing data and information. It visualizes data in a circular layout — this makes Circos ideal for exploring relationships between objects or positions. There are other reasons why a circular layout is advantageous, not the least being the fact that it is attractive. Circos is ideal for creating publication-quality infogr
“Heroes of CRISPR” Disputed
In a perspective piece published in Cell this week (January 14), Eric Lander, president and director of the Broad Institute of MIT and Harvard, outlined the history of achievements behind the precision gene-editing technique known as CRISPR. The problem is, the Broad is a copatentee embroiled in an intellectual property battle being investigated by the US Patent and Trademark Office (USPTO). And L
Addgene: CRISPR Guide
CRISPR Overview Class 2 Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeat (CRISPR) systems, which form an adaptive immune system in bacteria, have been modified for genome engineering. Prior to CRISPR, genome engineering approaches like zinc finger nucleases (ZFNs) or transcription-activator-like effector nucleases (TALENs) required scientists to design and generate a new nuclease pair for
» 英ゲノム解析センター、DRAGENによるゲノム解析の高速化を報告
John Russell ゲノミクス解析を高速化することはライフサイエンス研究の中でも最も過酷な課題のひとつだ。ディスクストリーミング、最適化並列ファイルシステム、アルゴリズム調整、高速プロセッサ、そしてハードウェア・アクセラレータなど挙げられる最適化のすべての方法は使われており、様々な結果を得ている。近頃、TGAC(The Genome Analysis Centre、イギリスのゲノム解析センター)は、完全な全領域の次世代シーケンサーの解析ワークフローを高速化するやめに特別に設計された最初のプロセッサの実装を報告した、Edico Genome社のDRAGENシステムだ。 最初の評価は非常に有望であった。トネリコの木の遺伝子に対するDRAGENのマッピングはTGACのローカルのHPCシステムよりも処理コアあたり177倍も高速であり、大規模データベースのひとつに関して3時間掛かっていたのがた
60秒でわかる？ 環境ストレスに強く高収量の作物の開発を目指す - YouTube
植物は、乾燥や低温、塩など生育環境が悪化しても移動して避けることができないので、そうした環境の変化を感知し、適応して生き抜く仕組みが備わっています。そのメカニズムを解明すれば、乾燥や低温・高温、塩害などに強い作物の開発につながり、食糧問題や環境問題の解決にも役立ちます。『理研ニュース』1月号の“研究最前線”で、環境資源科学研究センター 植物ゲノム発現研究チーム 関 原明（せき・もとあき）チームリーダーが、植物の環境ストレスへの適応メカニズム解明と、高収量の作物開発に挑む取り組みについて熱く語っています。この動画で関博士の60秒解説をご覧いただけます。 理化学研究所：http://www.riken.jp/ 環境資源科学研究センター 植物ゲノム発現研究チーム チームリーダー 関 原明（せき・もとあき） 博士（理学）
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Transcriptional Responses to the Environment Group
Bowtie2 cannot read gzip format files - SEQanswers
New York Genome Center (NYGC) - Homepage
Data Sharing, Data Scientists, and 'Parasites'
The Heroes of CRISPR
Michael B. Eisen, PhD | Investigator Profile | 2008-Present
UC Berkeley Researchers Improve CRISPR/Cas9 Technology for Short DNA Regions
PacBio Shares Rise Sharply Again Amid Relatively Quiet Month for Omics/MDx Stocks
People | Columbia University Department of Systems Biology
Jennifer E. Cremins
Faculty | Biomedical Graduate Studies | Perelman School of Medicine at the University of Pennsylvania
The Center for the Development of Therapeutics (CDoT)