租界〈Ｒ〉の門前にて
◇宣伝！— 三中信宏『みなか先生といっしょに 統計学の王国を歩いてみよう：情報の海と推論の山を越える翼をアナタに！』 2015年6月5日刊行，羊土社，東京，191 pp., 本体価格2,300円, ISBN:978-4-7581-2058-6 → 目次｜版元ページ｜コンパニオンサイト ◇連載〈統計の落とし穴と蜘蛛の糸〉 羊土社から発行されている雑誌『実験医学』2014年2月号から隔月連載された〈統計の落とし穴と蜘蛛の糸〉記事のオンライン版です． → オンライン連載トップページ 第1回 データ解析の第一歩は計算ではない（2014年2月号, pp. 442-447） 第2回 データの位置とばらつきを可視化しよう（2014年4月号, pp. 935-940） 第3回 データのふるまいをモデル化する（2014年6月号, pp. 1427-1433） 第4回 パラメトリック統計学への登り道〔1〕：ば
ggplot2 110129
2015年9月18日 (GTC Japan 2015) 深層学習フレームワークChainerの導入と化合物活性予測への応用 Kenta Oono
R 基本統計関数マニュアル 間瀬 茂 ii 目次 第 1 章 序 1 1.1 このマニュアルに付いて . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 1.2 その他の注意 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2
R 基本統計関数マニュアル 間瀬 茂 ii 目次 第 1 章 序 1 1.1 このマニュアルに付いて . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 1.2 その他の注意 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2 1.2.1 名前付き引数 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2 1.2.2 パッケージ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4 1.2.3 オブジェクトの属性とクラス . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5 1.2.4 クラス，
Nagoya.R#6 - 捨てられたブログ
R 勉強会 Nagoya.R#6 にて「モンテカルロサンプリング」というタイトルで発表してきました。棄却サンプリングや MCMC や ABC を紹介して，自分の専門である集団遺伝学の応用例を紹介しました。 発表スライド LT 感想 R と Google Earth を使った空間情報の可視化 rgdal パッケージと XML パッケージを使って KML ファイルを作成し， Google Earth に読み込ませるというお話。 GIS データはあまり扱わないけれど，データ表示にたまに使います。そういうときに思い出して参照させていただきます。 Beanplot で密度を観察する 箱ヒゲ図の中身を詳細に記したような感じの bean plot の紹介。自分のスライドの最後で示したような集団サイズの比較なんかに使えると思うので，今度使ってみようかなと考えています。 プレゼンに使えるきれいなグラフを R
Rの環境&パッケージ作成TipsおよびRGtk2ちょっとだけ - はやしのブログ Rev.3
タイトルの通りです。 パッケージ内に子環境を作ってオブジェクトを格納する 自作パッケージの関数で，パッケージの内部でしか使わない関数を大局的環境に読み込まないようにしたかった。twitterで聞いてみたところ，environmentという助言をid:syou6162にいただきました。 つまり，パッケージ内に子環境を作ってその中にオブジェクトを格納しておけば，子環境自体は大局的環境に読み込まれるものの，子環境の中のオブジェクトは大局的環境に読み込まれないわけです。 [パッケージ環境(大局的環境に読み込まれるオブジェクト[子環境(大局的環境に読み込まれないオブジェクト)])] こんな入れ子状になります。これは簡単にできます。 env.for.package <- new.env() assign("f", function(x, y){x*y}, envir=env.for.package)
igraphパッケージの使い方 2.グラフオブジェクトのプロット - もうカツ丼はいいよな
プロット igraphパッケージにはグラフオブジェクト(igraphクラス)をプロットするためのplot.igraph()関数が用意されている．勿論，使う場合はplot()関数にグラフオブジェクトを渡すだけでいい． > ## plot.igraph()が用意されている > g <- graph.tree(15) > plot.igraph(g) > ## plot()にigraphクラスのオブジェクトを渡せば呼び出される > plot(g) デフォルトではノードの配置は毎回変わる(後述)． レイアウト デフォルトではプロットの際にノードはランダムに配置される．ノードの配置はplot()のlayout引数にノードの座標を与えることで操作できるが，この座標をアルゴリズムによって決定し出力する関数がいくつか用意されている．これらの関数はlayout.から始まる名前を持っている． > ## lay
漢ならコードで語れ、ということで自分のパッケージを作った - yasuhisa's blog
何か自分のproductがあるといいよなーと思ったので卒研で書いたコードの断片をパッケージにして公開してみました。パッケージはここに置いています。 作ったものの説明ノンパラメトリック回帰の手法の一つであるナダラヤワトソン推定量を計算するためのパッケージです。そういうわけでnwパッケージという名前にしてみました。自分で平滑化パラメータ行列を与えてパラメータがどのような効果を持つか見てみることもできますし、クロスバリデーション関数を最小にするような平滑化パラメータ行列を計算させることもできます。内部を多少Cで書いているため、そこそこのスピードで動かすことができます。 後ろにも書いていますが R CMD INSTALL nw_0.01.tar.gz とやってインストールした後 library(nw) example(nw) とすると上に書いたことが始まります。 今のところ用意してあるカーネル関数
Rでの自作パッケージの作り方 - データサイエンティスト上がりのDX参謀・起業家
ふと自作パッケージを作りたい！！と思って挑戦し、なんとか調べながら作成することが出来ました。 R中級者になると自作関数も増えてきて、投稿目的でなくてもパッケージ管理したくなると思います。 パッケージ作成の大きな流れはこんな感じ 自作関数＆データをRコンソールに読み込む package.skeleton関数でパッケージのひな型を作る 説明ファイルの修正をする（DESCRIPTIONファイル、.rdファイル） コマンドプロンプトかターミナルでチェックとビルドを行う 紹介しているブログはいくつかありましたが、自分がネットで探してもよくわからなかった部分を本ブログで紹介します。 結論的には、少しCMDが使えれば自作のパッケージは作れます。 何段階か壁があると思いますが、多くの人がつまづくのは以下の点だと思う。 package.skeleton関数が上手くいかない description、rdファイ
R-bloggers
Introduction When working with large datasets in Excel, the ability to zoom in and out quickly can significantly enhance your productivity. If you often find yourself adjusting the zoom level manually, why not automate it with VBA? In this blog... [Read more...] The R Submission Working Group is making significant strides in promoting the use of R for regulatory submissions in the pharmaceutical i
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First draft on R Coding Conventions
- a first draft Version 0.8, February 2005 Henrik Bengtsson Division for Mathematical Statistics, Centre for Mathematical Sciences, Lund University, Sweden. Email: hb@maths.lth.se Adapted with kind permission from Java Programming Style Guidelines v3.0 by Geotechnical Software Services http://geosoft.no/javastyle.html. Please note that these guidelines are ours and not the R-develop
Google's R Style Guide
R is a high-level programming language used primarily for statistical computing and graphics. The goal of the R Programming Style Guide is to make our R code easier to read, share, and verify. The rules below were designed in collaboration with the entire R user community at Google. Summary: R Style Rules File Names: end in .R Identifiers: variable.name, FunctionName, kConstantName Line Length: ma
子どもの読書に関するアンケートの実施について(姫路市立図書館ホームページ)
市内小中学校20校に対し、小学校4年～6年、中学校1～3年の児童生徒を対象に、子どもの読書に関するアンケートの実施しました。このページはその集計と分析について報告いたします。 なお、アンケートに協力していただいた児童生徒のみなさん、実施協力くださいました小中学校の教諭の皆様にお礼申し上げます。 1 ． 調査目的 近年、図書館など子どもの読書環境は、充分とは言えませんが整えられつつあります。また、読書の意義についての社会認識の高まりから、幼い頃からの絵本などの読み聞かせを実施している家庭も多くなっています。しかし、一方で、2005年のOECDの学習到達度調査におけるPISAショック、子どもの活字離れ、公立図書館の児童貸出冊数の低下、学校読書調査における不読者層の増加など、子どもの読書を憂う状況が報告されています。 本年度、子ども読書活動推進計画（第二次）を策定するにあたり、図書館では子ど
Rを使えるようになるための10のこと - Issei’s Analysis ～おとうさんの解析日記～
Rは統計解析を行うことができる強力なツールです。計算上の信頼性はとても高く、世界中の分析者が日々分析用パッケージを公開しております。近年では行政機関で使われているという事例もちらほら聞きます。 ・姫路市役所での事例 これまでSASは使ってきたけどRは全く使ったことがない！JAVAとかC++とかガリガリ書けるけどRはよく分からない！という方々がすんなりRの世界に入れるよう、資料の探し場所や導入部分をまとめておきます。 ※まだ不完全ですが情報を入手し次第アップデートしていきます。 1. 資料を探す場所 CRAN R本体、パッケージ、PDF資料などの置き場 Task Viewに分野ごとのまとめ Searchでパッケージや資料の検索 CRANの読み方は「しーらん」派と「くらん」派でわかれる（どっちでもいいw） Rjpwiki 日本語で書かれている、これまでのRに関する資料の集大成 データの加工技、
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