1) GUI操作によるサーバ設定の改善: SoftEther1.0ではサーバー管理のための設定をコンソール画面で行う必要があったが、2.0で はGUI(グラフイカル・ユーザー・インターフェ−ス)に変わったため、操作が容易になった。 また、登録ユーザーの管理方法も大幅に改善され、リアルタイムで管理出来るようになった。 2) セキュリティー機能の向上: 1.0のセキュリティー機能は、ユーザー名とパスワードによる認証のみという簡素なものだった。 2.0ではNTドメインコントローラーやActive Directoryを利用した認証、さらには証明書認証や PKI 認証(「住民基本台帳カード」を使用したユーザー認証)、スマート カードを使用した認証に も対応するなど、複数の認証方式が用意された。 また、高度なセキュリティーポリシーやログ管理機能も搭載され、「管理オプション」による制限