As a continuation of the previous tutorial, I will show you a few more things you can do with VMD along with some tricks for PyMOL.  We’ll use a model for the phosphopantetheine tether of acyl carrier proteins.  This prosthetic tether forms a thioester linkage to amino acids and delivers them to the active sites of many different enzymes found most commonly in natural product biosynthetic pathways

自然分娩 本研究ではホルスタインの自然分娩（誘導分娩ではない分娩）の時期を調べました。 © 2016 The University of Tokyo, Photo Credit: Dr. JY Li, The University of Tokyo. 東京大学大学院農学生命科学研究科の米澤智洋准教授らの研究グループは、満月の頃に出産率が高まるという俗説が乳牛にはあてはまることを見出しました。 月の満ち欠け（月齢）と人の出産数との関係があるのかないのか、繰り返し調べられてきましたが、これまでの研究で明確な答えは出ていません。 米澤智洋准教授は次のように説明します。「月齢とヒトの出産の関係について明確な答えが得られないのは、社会的環境、母体の栄養状態、遺伝要因などの様々な要素が複雑に影響を及ぼしているから、月齢の影響を見えにくくしているかもしれません。ウシのデータを用いれば、これらの影響をかな

記事タイトルに反して僕は実は統計的検定が大嫌いなんですが、皆さんいかがお過ごしでしょうか（笑）。ということで、今回はややマニアックなメタアナリシスの話題でもしてみようかと思います。「t-testのメタアナリシス」みたいな、いわゆるRosenthal's methodとして知られているような一般的な話題にもちょっとだけ触れています。 今回想定しているシチュエーション 例えばですが、「あるパーソナライズされた*1動線改善を4つの異なるeコマースサイトで行った」みたいなケースを想定してみます。それぞれのeコマースサイトは独立した事業者であるため、統一したアクセス解析はできないものと仮定します。で、動線改善は「お気に入り→購入」のところに施したとして、ここでA/Bテストを行ったと仮定します。この時、アクセス解析の結果からいわゆる2×2分割表として サイトA 非CV CV 改善なし 250 125

列挙してみる 遺伝生殖関係 メンデル メンデルの遺伝の法則 集団遺伝学 木村資生 進化解析 系統樹 連鎖不平衡 遺伝的多様性 家系解析 連鎖解析 ゲノム特化事項 オミックス マルチオミックス 時空間離散化(個人・細胞) 量的生物学 統計関係 フィッシャー 離散変数 カテゴリカル変数 連続変数 多変量解析 離散確率過程 多重検定 多段階解析 統合解析 QC 量子確率論 尤度 ベイズ流 ゲノム疫学 データサイエンス関係 大規模データ解析 機械学習 深層学習 ゲーム理論 量子計算 量子計算機 情報関係 マルチバンディット ボルツマンマシン エントロピー 個人情報 数学関係 微分積分学 線形代数学 グラフ理論 情報幾何 多様体 確率微分方程式 物理学関係 波動関数 量子力学 医療関係 臨床ゲノム学 リスク遺伝子 責任遺伝子 リスクコミュニケーション 遺伝子診断 予防医学 出生前診断 個別化医療 倫

詳しい経緯は このまとめ を参照してください。時間軸でぶった切って各時点で検定を使う手法は、百歩譲って「差があるかどうか」は判定できるかもしれないけど、「どれほど異なるのか」については何も言えない。「どの時刻から異なるか」についても言えるか分からない。そこでベイズ統計モデリングで判断しようと思います。ベイズ統計モデリングでは多くの事前知識を仮定としてモデルに組み込みますが、検定も多くの仮定を前提にしている点は同様と思います。 データは雰囲気だけ似せて自作しました。野生型100個体、変異体10個体で1～24まで1時間ずつ測定して24時点としました。まとめを見ると144時間みたいですが24時間に簡略化します。データの構成は以下です。 type X1 X2 … X23 X24 0 0.071 0.555 … -0.236 -0.597 0 0.445 0.483 … -0.149 0.231 0

何らかの指標の時系列が複数あるときに、ある時点で２群が違うかどうかを言いたいときにはどんな統計手法を使えば良いか？という質問に対するいろいろなコメントや提案。複数のストリングが混ざってて読みにくい部分や、関連性の低いツイートも混ざってますが、なんとなく全体の話の流れが追えればいいなと思いまとめました。これからも関連ツイート増えると思うので、追加や漏れに気づいた方ぜひ追加してください。

むかしむかし、D１の時にやった学内のセミナーのスライドです。ハードディスクを整理してたら出てきたので、何かの役に立つかもしれないと思いシェアしてみました。 →　ダウンロードはこちら https://www.docswell.com/s/rtachi-lab/KLP3G5-2022-08-28-155727Read less

"Reddish green" redirects here. Reddish Green is also a place in Reddish, Greater Manchester, UK. The human eye's red-to-green and blue-to-yellow values of each one-wavelength visible color [citation needed] Human color sensation is defined by the sensitivity curves (shown here normalized) of the three kinds of cone cells: respectively the short-, medium- and long-wavelength types. Impossible colo

神経科学：網膜神経節細胞には多数の種類がある 2016年1月21日 Nature 529, 7586 網膜神経節細胞（RGC）は、網膜から脳へ視覚情報を伝達する。何種類のRGCが存在し、それらがどのように分類されるのかは長年の疑問であった。今回T Eulerたちは、2光子カルシウム画像化法を用いてマウス神経節細胞層のパッチの1万1000以上の細胞で刺激に対する応答を記録し、得られたデータに対して教師なしクラスタリングを行った。この結果、マウスの網膜はこれまで知られていなかった数種類を含む30以上の機能の異なるRGCタイプを有することが示された。この数字は現行の推定値よりもかなり多く、RGCの機能的多様性は従来考えられていたよりも大きいことが示唆される。