2014年6月21日に開催した、アメリエフ株式会社・第33回バイオインフォマティクス勉強会の「フリーソフトではじめるがん体細胞変異解析入門」のスライドです。
Kashiwa.R#9 Rでゲノム解析
2014年6月21日に開催した、アメリエフ株式会社・第33回バイオインフォマティクス勉強会の「フリーソフトではじめるがん体細胞変異解析入門」のスライドです。
1万円の遺伝子解析で分かる衝撃の事実：日経ビジネスオンライン
「ヒトゲノム」という言葉をご存じだろうか。ヒトは人間で、ゲノムは全遺伝情報の意味。人間の詳細な“設計図”がヒトゲノムである。 ヒトゲノムの解読を完了した──。2000年6月、米国のビル・クリントン大統領（当時）と、英国のトニー・ブレア首相（当時）は、衛星回線を使って異例の会見を開いた。国際研究グループと米ベンチャーのセレーラ・ジェノミクスが10年越しの研究で達成した成果に対し、「20世紀の科学進歩の中で最高の発見だ」とクリントン大統領は最大級の賛辞を送った。 世界中に伝えるべき偉業として称えられたのは、大きく2つの理由があった。まずヒトゲノムの解読は、膨大なデータ＝ビッグデータの処理が必要で、極めて困難とされてきたからだ。人間1人当たりの遺伝子に含まれる23対の染色体を構成する31億もの塩基対の配列を解析しなければならない。 もう1つはヒトゲノム解読により、将来的に期待できるメリットの大き
カイ２乗分布，カイ２乗検定
■カイ２乗分布（χ2分布）[chi-square distribution] ･･･ 比率の検定 ※ このページは推定･検定の内容を前提としています． ◇簡単な例でイメージ作り(1)◇ 例１ 日本人のABO式血液型の分布はおよそＡ型40%，B型20%，AB型10%，O型30%だといわれている．ある村で献血に応じた者のうち先着100人の血液型は次の表のとおりであった．(ただしデータは架空のもの）
Fisherの正確検定
はじめに Fisher（フィッシャー）の正確検定（Fisher's exact test）は，分割表（クロス集計表）の各行（各列）が独立かどうかを調べる方法です。直接確率法とも呼ばれます。 この方法はFisherが1935年に著した The Design of Experiments という本の序章の次の第2章の最初に出てくる有名な lady tasting tea の問題を解くために使われています。Fisherの帰無仮説の考え方を最初に説明したものとしても有名です。 2×2分割表の検定 2008年12月8日のニュースによれば，麻生内閣の支持率が前回と比べて半減しました。ネットで調べられる限りの結果を私のブログに載せました。これを見ると，20.9%から25.5%と，かなりばらつきがあります。このばらつきは偶然と考えていいでしょうか。 回答数のわかっている調査について，人数に直すと，次のよう
【レベル高すぎ】ナショジオが募集した「変わり続ける、諸行無常な世界」に集まった超絶写真 26選:DDN JAPAN
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