Simple Fast Exploratory Data Analysis in R with DataExplorer Package
Exploratory Data Analysis plays a very important role in the entire Data Science Workflow. In fact, this takes most of the time of the entire Data science Workflow. There’s a nice quote (not sure who said it): “In Data Science, 80% of time spent prepare data, 20% of time spent complain about the need to prepare data.” With R being the go-to language for a lot of Data Analysts, EDA requires an R Pr
A Brief Introduction to caretEnsemble
A Brief Introduction to caretEnsemble Zach Mayer 2023-09-20 caretEnsemble is a package for making ensembles of caret models. You should already be somewhat familiar with the caret package before trying out caretEnsemble. caretEnsemble has 3 primary functions: caretList, caretEnsemble and caretStack. caretList is used to build lists of caret models on the same training data, with the same re-sampli
RユーザーのためのJulia100問100答 - りんごがでている
R Adevnt Calendar 8日目の記事です。大幅に遅れて大変申し訳ないです。 この記事ではR言語ユーザーのために100問100答形式でJuliaを紹介していこうと思います。 Julia言語 Juliaってどういう言語なの? Juliaは高レベルでハイパフォーマンスな技術計算のための動的言語だよ。書きやすさと実行速度の両立がウリの言語だよ。 誰が作ってるの? 主にボストンのMITの人達が中心に作っている言語だよ。特にJeff Bezonson, Stefan Karpinski, Viral Shah, Alan Edelmanの4人が初期の重要人物だよ。 自由に使えるの? Juliaの処理系はMITライセンスで配布されているから、商用でもなんでもかなり自由に使えるよ。 どれくらい速いの? すごく速いよ！大体C言語の2倍以内くらいの収まる速度だよ。 Rと比較してどうなの? 数倍から
モダンなRによるテキスト解析 - Qiita
概要 すぐに使えるKNBCコーパスを対象に、モダンなRの書き方でテキスト解析したときのメモです。TF-IDFや共起頻度（ネットワーク作成）、LDAやGloVeまでをパッケージで実行しました。 - 解析済みブログコーパス 定義・設定 最初に処理で利用するライブラリの読み込みや定数・関数の定義。 library(pacman) library(widyr) # 読み込むパッケージ SET_LOAD_PACKAGE <- c("tidyverse", "Rcpp", "chunked", "tidytext", "visNetwork", "textmineR", "Matrix", "topicmodels", "LDAvis", "text2vec") # コーパスファイルの設定 SET_CORPUS_FILE <- list( DOWNLOAD_URL = "http://nlp.ist.
tabulizerパッケージによるPDF表データからのデータ取得
tabulizerパッケージによるPDF表データからのデータ取得 👤 Shinya Uryu 📆 2016年8月24日（水曜日） ROpenSciの実験的パッケージリポジトリropenscilabsで、便利そうなパッケージを見つけた。 {tabulizer} というものだ。このパッケージは Tabula というオープンソースツールの機能を利用して、PDF中に含まれる表から、値を取り出すというもの。 政府や企業の報告書はPDFであることが多く（二次利用を想定していないのだろうが）、表としてデータが収められていることがしばしばある。PDFからのデータ取得方法として、Rでは {tm} を 使う方法 や {pdftools} を 利用する方法 がそれぞれあるが、 {pdftools} ではテキストベースでの抽出となるため、表データの抽出からRの特徴とも言えるデータフレーム形式への変換が困難であ
Rによる統計解析と可視化
This document contains R code for exploring various R functions and packages. It downloads an R script from GitHub, loads packages from CRAN and Bioconductor, explores basic functions like plotting, looping, and object manipulation, and creates an R package skeleton. The code covers many fundamental and advanced R topics.Read less
Spike-and-slab - 驚異のアニヲタ社会復帰の予備
読んだ Nat Genet. 2016 Aug 1. 様々なデータを取ってきて、遺伝子との相関があるかを解析するわけだが、サンプルの人数、組織、遺伝子の3次元をサンプル×要素(component やfactor と呼ぶ)と要素×遺伝子の行列に分解することで、テンソル分解してデータの構造をいじる。 もちろん、時間次元をいれて4次元テンソルとかN次元テンソルとかも発展版ができる。 遺伝子を扱うときは、たいてい、遺伝子発現データが数万で、サンプルが100から1000といういわゆるp>>n 問題に直面する。そのため、spike-and-slabという方法で変数を減らしている。 個の変数がモデルにあるとする。はと同じ長さで、である。0ならばモデルにパラメータを取り入れず、1なら採用する、というフラグである。が採用される確率は、特に理由がなければベルヌーイ分布を使う。 モデルは普通にパラメータに対して
win-builder.R-project.org
Building and checking R source packages for Windows. This site provides services for building and checking R source packages for Windows. This service is intended for useRs who do not have Windows available for checking and building Windows binary packages. Windows useRs can easily build and check their packages on Windows with the setup described in the R Installation and Administration manual. P
Plotly
Plotly R Open Source Graphing Library Plotly's R graphing library makes interactive, publication-quality graphs. Examples of how to make line plots, scatter plots, area charts, bar charts, error bars, box plots, histograms, heatmaps, subplots, multiple-axes, and 3D (WebGL based) charts. Plotly.R is free and open source and you can view the source, report issues or contribute on GitHub.
データ分析環境の構築にDockerを利用しよう
📜 要約 コンテナー管理ソフトウェアのDockerを利用することで、データ分析の場面で利用頻度の高いRおよびPythonの分析環境として実行することが出来るRStudio Server、Jupyter、Beaker Notebookを容易に構築可能になる。Dockerを使うことの利点として、複数人でのデータ分析や将来の利用面においてデータ分析結果の再現性を高められると考えられる。 🍵 前置き〜データ分析者が直面する再現性への挑戦 データ分析の結果が、自分以外では再現できない、同じデータを使っているのにナンデ！？ということが時々あります。その原因として多いのが分析に関わる人間が利用する実行環境の違い、です。大きなものではOS、小さなものでは分析に利用するツール本体や拡張機能（パッケージやモジュール）のバージョンの違いがあります。 こうした再現性の問題は、複数人でデータ分析を行う時だけでな
ARIMAX で祝日効果を盛り込んだ時系列予測モデルの作成 - ほくそ笑む
1. はじめに うちのブログは平日のアクセス数が休日の 2 倍くらいあります。 みなさんお仕事で必要になったときに検索されて、このブログたどり着くのでしょうか。お疲れ様です。 さて、『データサイエンティスト養成読本 R活用編』という書籍で、ARIMAX モデルを用いた時系列分析のやり方が載っています。 データサイエンティスト養成読本 R活用編 【ビジネスデータ分析の現場で役立つ知識が満載! 】 (Software Design plus) 作者: 酒巻隆治,里洋平,市川太祐,福島真太朗,安部晃生,和田計也,久本空海,西薗良太出版社/メーカー: 技術評論社発売日: 2014/12/12メディア: 大型本この商品を含むブログ (7件) を見る 今日は、この書籍を参考に、うちのブログのアクセス数を ARIMAX モデルを用いて予測してみようと思います。 2. データの準備 まず、データですが、2
R言語scale()での正規化バリエーション - jnobuyukiのブログ
以前、データの正規化にはいろいろな方法があることを述べました。 数量の正規化：方法の違いは何を意味するか？ - jnobuyukiのブログ いろいろな正規化をやってくれるコマンドにR言語のscale（）があります。 この関数は、何も考えずに使ってもそれなりに動きます。 しかし、引数として含まれるパラメータを利用すると、もっと便利です。 scale()の引数 scaleには3つの引数があります。 1. 行列（matrix）オブジェクト: ここに当てはめた変数を正規化します。 2．center: パラメータの値として3種類あります。 TRUE: デフォルトの値です。行の平均値を全てのケースから引きます。 FALSE: 引き算をしません。 数値ベクトル: 数値ベクトルの値をケースのそれぞれから引きます。 3. scale: centerと同様3種類の設定が可能です。 TRUE: デフォルトの値で
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How to Build an Ensemble Of Machine Learning Algorithms in R - MachineLearningMastery.com
Using miniCRAN in Azure ML
Imputation of Missing Values using Random Forest
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Network visualization in R with the igraph package