DiagrammeR 〜RでGraphvizを使う~ - Ｒ言語による電子カルテデータの二次利用
パワポでフローチャートや、ネットワーク図を作ると、ノードやエッジの位置が微妙にずれて、面倒だなと感じる人はいませんか。そんな時は、Graphvizを使用しましょう。 Graphvizを使うと、DOT言語で書かれたグラフを画像に出力できます。R言語では、DiagrammeRのgrViz関数で、DOT言語のテキストを画像に出力します。 目次： DiagrammeR::grViz() DOT言語 DOTの構造 RstudioでDOT言語 Graphviz Attributes Graph属性 Node属性 color属性 shape属性 style属性 rank属性 label属性 image属性 Edge属性 arrowhead属性 dir, arrowsize, color, penwidth属性 port属性 Subgraph 参考 環境 DiagrammeR::grViz() Diagr
R と RStudio でのデータ分析 入門
R と RStudio でのデータ分析 入門 太郎丸 博 Thursday, April 09, 2015 データの分析には、 データの読み込み（あるいは呼び出し）、 分析できるようにデータを整形、 探索的分析、最終的な分析結果の確定、 図や表の整形、レポート／論文の執筆 といったプロセスがある。これらを Windows 上の R と RStudio で行う方法を概説しよう。 1 read.csv データの読み込み データはふつうEXCELのような表計算ソフトなどで行い、それを R のような統計解析ソフトに読み込むことが多い。分析の第一歩はデータを統計解析ソフトに読み込むことであるが、けっこう失敗しやすいので注意。 1.1 setwd 作業ディレクトリの指定 データを読み込む前に、作業ディレクトリ（作業フォルダともいう）を指定する。作業ディレクトリとは、Rがデフォルトでファイルの読み書きを
installr パッケージで R のバージョンアップ - Data science & Software development
installr パッケージ は Windows 版 R のバージョンアップや Rstudio や git などの外部アプリケーションのインストールが R から行える R パッケージで、R-bloggers の管理人でもある Tal Galili 氏によって開発されています。 また、R のアンインストール、OS のリブート、RGui と RStudio のどちらからから実行しているかの確認など、インストール関連の機能も有しています。 この記事では installr を使って R のバージョンを行う方法と installr パッケージで Rstudio をインストールする方法を紹介します。 installr パッケージをインストールし、ロードする R を起動し、下記コマンドを実行します。 install.packages("installr") library(installr) R のバー
Amazon RedshiftとRによるデータ分析をやってみる | DevelopersIO
RからRedshiftに接続する Rは、フリーの統計解析ソフトです。様々なデータソースを扱うことができます。今回は、Redshiftをデータソースとして扱い、クエリーを実行してみたいと思います。 Amazon LinuxにRをインストールする まずは、Amazon Linux上に後から必要になるパッケージを一通りインストールします。Amazon Linux-2015.3を用いています。 $ sudo yum install -y R git libxml2-devel openssl-devel libcurl-devel libjpeg-devel libpng-devel mysql-devel 続けて、Rの管理コンソールを提供するRStudioをインストールします。 $ wget https://download2.rstudio.org/rstudio-server-rhel-0.
RStudio (非公式日本語版)
キーボードショートカット コンソール説明Windows & LinuxMac コンソールにカーソルを移動する Ctrl+1 Ctrl+1 コンソールをクリアする Ctrl+L Command+L カーソルを行の最初に移動する Home Command+Left カーソルを行の最後に移動する End Command+Right コマンド履歴を行き来する Up/Down Up/Down コマンド履歴をさかのぼる Ctrl+Up Command+Up 現在実行しているコマンドを中断する Esc Esc カーソルまで行を引っ張る Ctrl+U Command+U カーソルの後ろに行を引っ張る Ctrl+K Command+K 現在引っ張っているテキストを挿入する Ctrl+Y Command+Y ソース説明Windows & LinuxMac ソース文書にカーソルを移動する Ctrl+2 Ctrl
第2回 レポートづくりを加速せよ ～R Markdown環境の導入＆チュートリアル～ | gihyo.jp
前回はレポートづくりのオートメーション化がもたらすメリットについてやや概念的な説明をしました。今回はR Markdown環境を導入し、レポート作成の手順を説明します。実際に簡単なレポートづくりを体験して、R Markdownの威力を味わってください。 また、実務を想定した（とは言っても非常に単純化したものですが）2種類のチュートリアルを用意しましたので、これらのチュートリアルを通してオートメーション化されたレポートづくりを自分の仕事の中でどう活かすか想像してみてください。 なお、本連載記事に関する疑問・質問・コメントなどは著者Twitterアカウント（@kohske）でも受け付けていますのでお気軽にどうぞ。 R Markdown環境の導入 R Markdownを利用するには、 R {rmarkdown}パッケージ pandoc の3つのツールを導入する必要があります。 PDF形式のレポート
dplyrを使いこなす！基礎編 - Qiita
はじめに 4月ということで、新卒が入ってきたりRを使ったことないメンバーがJOINしたりしたので、 超便利なdplyrの使い方を何回かに分けてまとめて行きます。 Rは知らないけど、SQLとか他のプログラミング言語はある程度やったことあるみたいな人向けです。 dplyrを使いこなす！シリーズ 基礎編以外も書きましたので、↓からどうぞ。 * dplyrを使いこなす！Window関数編 * dplyrを使いこなす！JOIN編 dplyrとは データフレームの操作に特化したパッケージです。 Rは基本的に処理速度はあまり早くないですが、dplyrはC++で書かれているのでかなり高速に動作します。 ソースの可読性もよくなるので、宗教上の理由で禁止されている人以外は使うメリットは大きいです。 処理可能なデータサイズの目安 あくまでも個人の環境に強く依存した感覚値ですが、1000万行、100MBぐらいのデ
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からだにいいもの
心理学者のためのGlmm・階層ベイズ
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