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SoftwareとBioinformaticsに関するAKIYのブックマーク (1)

  • Pajek入門 -巨大ネットワーク分析用フリーソフトウェア-: それゆけBioinformatics

    Pajek official site Developed by Vladimir Batagelj and Andrej Mrvar at the University of Ljubljana, Slovenia. 1. Pajek概要 Pajekは、フリーのWindows (32 bit)用の巨大なネットワーク分析プログラムである。 Yeast two-hybrid (Y2H)法によるタンパク質-タンパク質相互作用ネットワークのような大量データ(多数のタンパク質がある)をネットワーク分析する際に、行列表示に基づく標準的なネットワーク分析ツールで効率的に扱うことは非常に困難である。大量なネットワークデータに対してPajekが出来ること・目指すゴールは以下の通りである。 (1) 巨大なネットワークを小さなネットワークへと分離・抽出する (2) ユーザにネットワークの強力な視覚化ツールを提

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