バイオインフォマティクス用オリジナルツール
[an error occurred while processing this directive] GenomeViewerをバージョンアップしました BLAST2.0データ用コマンド ・一部ツールをLinux用に移植しました。ダウンロードはこちらから。 ・GenBankファイルなどのビューワのダウンロードを開始しました。 画面イメージ GenBankファイルを処理するためのC++用ライブラリが完成しました。 同様なライブラリがPerl、Java用などに用意されているようですが、使ったことがないので詳細は不明です。 C++で作ってもNCBIからダウンロードしたファイル(たとえばgbpriN.seqなどの250Mバイト程度のもの)を処理すると、かなり処理時間がかかります。 インタープリタのPerlやJavaで作成したライブラリで、処理速度の問題はないのでしょか？ 今回作成したライブラリは
BioDASのウィキ化 - kwg memo
http://bonohu.jp/t/20061107.html#p01 BioDASのウィキ化と聞いて、あらぬ妄想を抱いてしまった。http://biodas.org を Wiki化する、というシンプルなことなんですね。妄想はげしいなぁ > 自分 で、何を妄想したかというと、DASアノテーションをWikiっぽいインターフェースで編集する、ということ。gbrowseやそれなりのゲノムブラウザなんかでは、アップロードしたgffファイルなんかに限って、wikiっぽいインターフェースで編集できる。こういう用途に特化したDASサーバについての議論か？ということ。妄想したアプリケーションを整理すると、(^^; あるdas wikiサイト(仮)へとぶ 自分用のアノテーションページを作る ここに、自分のアノテーションをwikiで（たとえばgffで）コツコツ記入する 「保存」とかすると、記入されたアノテー
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Allegro Common Lisp 2006 November Seminar (Japanese)