LSBM
国際共同研究により明らかになった胃がんの遺伝子ネットワーク「Gastrome」 ゲノムサイエンス分野では、アジアにおいて主要な位置を占める胃がんの分子病態を解明することを目的として、University of Melbourne、Peter MacCallum Cancer Centre（オーストラリア）、University of Hong Kong、Queen Mary Hospital（香港）、National Cancer Centre（シンガポール）、Yonsei University、Yonsei Cancer Center（韓国） と連携して2004年より「アジア太平洋胃がんゲノミクスコンソーシアム(Gastric Cancer Genomics Consortium, GCGC)」を設立し、共同研究を開始しました。 その最初の成果として、星田研究員（現在Broad研究所
DBSubLoc - SOAP Server
DBSubLoc Database of Protein Subcellular Localization Institute of Bioinformatics, Tsinghua University. Server information : We build a SOAP server based on SOAP::Lite perl module. The WSDL file is provided, which makes it easy to build a client library for a specific computer language. SubLoc.wsdl Go to this page to learn how to write a client program for SubLoc SOAP Server. At present, six fu
EEL - Enhancer Element Locator メモ - Ctenophoraの日記
だいぶご無沙汰です。多少お疲れ気味らしい。 ソフトは以下のサイトから GPL で。 http://www.cs.helsinki.fi/u/kpalin/EEL/ 原著はこちら Genome-wide Prediction of Mammalian Enhancers Based on Analysis of Transcription-Factor Binding Affinity しっかり読むのが楽しみ。 もう一丁。こちらは RISC と記憶の話。こちらもメモのみ。 Synaptic Protein Synthesis Associated with Memory Is Regulated by the RISC Pathway in Drosophila
Enhancer Element Locator
Enhancer Element Locator, or EEL, is a tool for locating distal gene enhancer elements in mammalian genomes by comparative genomics. News EEL is not dead! It is continually maintained and developed and new features will be published in due course. The latest public source code is available at github repository. Database access (discontinued on 3.10.2016)) The web based database access to precomput
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http://gclust.c.u-tokyo.ac.jp/
PhosphoregDB: The tissue and sub-cellular distribution of mammalian protein kinases and phosphatases - BMC Bioinformatics
DBSubLoc - SOAP Server
http://video.google.com/videoplay?docid=-4300603676630945943&q=bioinformatics
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http://www.kyoritsu-pub.co.jp/kinkan/shosai/kin05628-0.html
http://biowulf.nih.gov/apps/blast/doc/fastacmd.html
Genome Network Platform
Conjugate Gradient Method -- from Wolfram MathWorld
http://chalk-less.org/~thecla/d/?date=20060123
http://bioteam.net/intel_benchmarks/
The Deimos Project / Discussion / Help
Arcady Mushegian - Stowers Institute for Medical Research
GO::TermFinder—open source software for accessing Gene Ontology information and finding significantly enriched Gene Ontology terms associated with a list of genes
http://blog.se-se.jp/2006/01/gene_ontology.html
http://open-bio.osdn.jp/?meeting2-log