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- バイオインフォマティクスと統計科学
統計数理研究所のセミナーに参加。ここでは文献のみにしようかと思ったが、せっかくなのでセミナーのサマリーも掲載。 ■10:30-11:10 石井 信 先生(奈良先端大・情報科学) マルチクラス分類器の構成法と癌マイクロアレイ分類への応用 Classificationの手法として、2値分類を複数組み合わせた分類器をつくり、多値問題を解決する、という もの。これまでの手法では、サンプルはそれぞれ独立という過程のもとであったが、サンプル間の相関を考慮に入れて、 重み付けをしてアルゴリズムに組み込むことで、分類器の精度を向上させたという内容。コンセプト的には、識別能力の 低い分類器の組み合わせ、ということで、AdaBoostとコンセプトは同じといえるでしょう、とのこと。 ■11:20-12:00 冨田 秀太 先生(名古屋大・医) 発現プロファイル解析に基づく肺癌分類と臨床分子病態との相関 アジレント
EEL - Enhancer Element Locator メモ - Ctenophoraの日記
だいぶご無沙汰です。多少お疲れ気味らしい。 ソフトは以下のサイトから GPL で。 http://www.cs.helsinki.fi/u/kpalin/EEL/ 原著はこちら Genome-wide Prediction of Mammalian Enhancers Based on Analysis of Transcription-Factor Binding Affinity しっかり読むのが楽しみ。 もう一丁。こちらは RISC と記憶の話。こちらもメモのみ。 Synaptic Protein Synthesis Associated with Memory Is Regulated by the RISC Pathway in Drosophila
Enhancer Element Locator
Enhancer Element Locator, or EEL, is a tool for locating distal gene enhancer elements in mammalian genomes by comparative genomics. News EEL is not dead! It is continually maintained and developed and new features will be published in due course. The latest public source code is available at github repository. Database access (discontinued on 3.10.2016)) The web based database access to precomput
バイオインフォマティクスと統計科学
2006.1.30 レジメはここです． パスワードはシンポ中にお話したものです． 二週間程度したらＨＰから削除します．＃削除しました（2006.2.24）
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http://pubs.acs.org/cgi-bin/abstract.cgi/jprobs/asap/abs/pr0503681.html
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http://www.mainichi-msn.co.jp/shakai/wadai/news/20060105k0000e040059000c.html
asahi.com：受験生「まさか今年も」 センター試験リスニング不調 - 暮らし
asahi.com：[2007/01/16]レジ袋削減、一足お先 杉並のスーパーで有料化実験 [2006/01/16]ダイオキシンひと飲みスーパー細菌 京大グループ発表 - 暮らし
https://academic.oup.com/nar/redirect-unavailable?url=nar.oxfordjournals.org/content/vol33/issue8/aindex.dtl
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http://www.primate.or.jp/PF/yasuda/
http://www.yomiuri.co.jp/science/news/20060108i203.htm
Arcady Mushegian - Stowers Institute for Medical Research
http://www.yomiuri.co.jp/science/news/20060108i504.htm?from=main5
GO::TermFinder—open source software for accessing Gene Ontology information and finding significantly enriched Gene Ontology terms associated with a list of genes
A compendium of Caenorhabditis elegans regulatory transcription factors: a resource for mapping transcription regulatory networks - Genome Biology