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2009年9月24日のブックマーク (2件)

  • 研究に使うプログラムを Perl で書こう

    プログラミング言語 Perl の基礎の解説ページです. 科学の研究を進めるなかで,自分でプログラムが書けると便利なことはたくさんあります. (>参考: 自分の研究に使うプログラムを自分で書こう ). でも,すべての研究分野でプログラミングがみんなの常識になっているわけではありません. Perl は,このごろはウェブのCGI プログラムに使われることで知名度が高くなりましたが, データの処理だの簡単なシミュレーションだのに便利に使える言語です. そんな道具を自分のものにしたい人の自習の手助けになることを目指して入門講座を作ってみました. もともと「生物系研究者のための Perl 基礎の基礎」と題してましたが, あえて「生物系」と限定するのをやめました(2004年 3月). 生物系に限らず,自分でプログラムを書いたことがない学生・研究者が, データ処理やシミュレーション計算のためにPerl

  • [B! R][bioinformatics] ma_koのブックマーク

    ArrayExpressHTS - RNA-Seq Processing Pipeline ArrayExpressHTS is an R based pipeline for pre-processing, expression estimation and data quality assessment of high throughput sequencing transcriptional profiling (RNA-seq) datasets. The pipeline starts from raw sequence files and produces standard Bioconductor R objects containing transcript measurements for downstream analysis along with web report