Points of significanceコラム 2：統計における推定と検定(1) | 一人抄読会
Points of significance: Significance, P values and t-tests. Krzywinski M, Altman N. Nat Methods. 2013 Nov;10(11):1041-2. Points of significanceの第2回では、まず(1)母集団概念と統計的推測の時制についてまとめ、(2)母集団からこれから観測するデータを「予言」する方法について触れた後、(3)観測したデータからもとの母集団を「推測」する統計的推定を4段階で理解する。最後に(4) Nature Methods総説にある仮説棄却による統計的検定の例を見る。 1. 母集団概念と統計的推測の「時制」 (1) 母集団と統計的推定 統計学では、抽象的な概念である「母集団」(無限母集団)というものを想定している。母集団は、具体的に見たり数えたりできない架空の存在であ
生命科学研究の電気泳動画像は揺らいでいた—学術論文の画像加工の実態調査 - [Science Postprint]
Abstract 論文の信頼性向上を目指し、生命科学（医学も含む）分野の電気泳動実験における「画像加工」の頻度や傾向を調査した。Nature誌、PNAS誌を対象とし、全374件の論文の画像加工を検証した。その結果、2000年～2006年のNature誌302件において、20件6.6％が画像加工の可能性が高いという結果となり、画像加工の可能性が示唆されるものも合わせると、72件23.8%もの論文が該当した。また、PNAS誌（2003年 Vol.100(1)～100(3)）では日本人名が含まれる論文と含まれない論文で比較検討したところ、日本人名が含まれる論文で画像に疑義のあり調査・検証が必要と考えられる論文の率（画像加工要調査率）は42.9%となり、日本人名が含まれない論文での17.2%と比べて有意（P Author and Article Information Author infoゼネラ
5分でわかるベイズ確率
ベイズ統計学の基礎概念からW理論まで概論的に紹介するスライドです．数理・計算科学チュートリアル実践のチュートリアル資料です．引用しているipynbは * http://nhayashi.main.jp/codes/BayesStatAbstIntro.zip * https://github.com/chijan-nh/BayesStatAbstIntro を参照ください． 以下，エラッタ． * 52 of 80：KL(q||p)≠KL(q||p)ではなくKL(q||p)≠KL(p||q). * 67 of 80：2ν=E[V_n]ではなくE[V_n] → 2ν (n→∞). * 70 of 80：AICの第2項は d/2n ではなく d/n. * 76 of 80：βH(w)ではなくβ log P(X^n|w) + log φ(w). - レプリカ交換MCと異なり、逆温度を尤度にのみ乗す
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Error bars in experimental biology
