Rによるバイオインフォマティクスデータ解析（第２版） - Loud Minority
著者の樋口さんより献本頂きました．ありがとうございます． この本が合う人は明確です． Rで何が出来るか眺めたい． Rを使い始めて，使い方を検索エンジンで検索したが，全然見つからない（入れるべき単語が分からない） RJpWikiとか眺めたけど，専門用語っぽいものがわからないので，俯瞰したい． 理論はどうでもよいので，Rで出来そうな事を一通り見てみたい というタイプの人です．これ一冊でRが1から10まで分かる事はありませんし，データ解析のイロハが分かる事もありません．ましてや，バイオインフォマティクスが何かにも答えてはくれません．例題も時々DNAの塩基配列やBioconductor(Rを用いたバイオデータ解析用の一連のコマンド群)が出てきますが，例題として出ている感じです． なので，はじめから最後まで通して読むのではなく，辞書的に使う本です．特に図を眺めて，自分の目的にあった検索用語を調べるた
Rによるバイオインフォマティクスデータ解析 第2版 -Bioconductorを用いたゲノムスケールのデータマイニング
内容はバイオインフォマティクスに限らずに割と広い内容をカバーした感じで、クックブックと逆引きの中間的なスタイルと言えば良いのだろうか？ Rのインストールから基本的な操作は（大体どの本にもあるように）載っていて データマイニングとしては PCA ICA PLS MDS SPE k-means,Fuzzy cmeans spectral clustering NMF SOM decision tree kNN SVM RF LASSO MARS がサンプルコードとともに簡潔に説明されている。 8章はバイオ系データの解析、チップとか。odesolveを利用したシミュレーションのサンプルもあって、SBMLRは面白そうだなぁと思った。メカニズムがどうなっているのかはモデルと実験系の不一致をよく突き詰めて考えることでしかきちんとした理解は得られないと思っている。 最後のほうの章は統合環境、データベース
共立出版株式会社 新刊・近刊2011年1月『Rによるバイオインフォマティクスデータ解析 第2版−Bioconductorを用いたゲノムスケールのデータマイニング−』
Rによるバイオインフォマティクスデータ解析 第2版 −Bioconductorを用いたゲノムスケールのデータマイニング− （ISBN978-4-320-05708-1） 樋口千洋 著 B5，336頁，4600円 ●内容 医学・生物学の分野では，マイクロアレイやプロテオミクスなどのゲノム関連データ解析の発展に伴い，大量のデータ解析を日常的に行うことが多くなってきた。このような状況において，統計解析環境RとそのアドオンソフトBioconductorは，もっとも有望なオープンソースのデータ解析ソフトとして，利用者もますます広がってきた。 本書は，ゲノム解析に関するデータ解析について，特にマイクロアレイ解析に偏ることなく，蛋白質解析，データベースとの連携など，バイオインフォマティクス全般についてできるだけ多くのパッケージの利用方法について、平易に解説している。また，初版執筆時より，統計
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