Illumina HiSeq2000によるシーケンシングサービスを開始いたしました! 表1. 当社で取扱いしている次世代シーケンサー 表2. Illumina社 HiSeq2000 データ量(Illumina社のカタログより抜粋) 表3. Illumina社 GAIIx データ量(Illumina社のカタログより抜粋) 表4. Roche(454)社 GS-FLX データ量(Roche社のホームページより抜粋) 当社では、次世代シーケンサー Illumina社「HiSeq2000」、「Genome Analyzer IIx(GAIIx)」やRoche(454)社「Genome Sequencer-FLX(GS-FLX)」を中心とした、DNAシーケンシング解析サービスをご提供いたします。キャピラリーシーケンシングとは比較できないほどの解析能力で、Mb~Gb単位の塩基配列解析を行います。ぜひ一
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私は、2011年から理研横浜研究所生命情報基盤研究部門にて、サイエンスをわかりやすく伝え、理解を増進するための業務を行っています。久しぶりに、生化学・バイオインフォマティクスの研究チームに加わることが出来て、とても嬉しく思っています。 これまでは、DNA研究の初期の頃にマサチューセッツ工科大学のDr. D Housman研究室を訪問して研究現場の実態調査を行ったり、アメリカの公共・民間放送で、サイエンスドキュメンタリーの制作に数年間携わったりしました。1991年に家族と一緒に来日してからは、技術系企業のマーケティングやPRの仕事に携わってきました。 ここBASEでは、人類が直面している地球規模の問題解決のために、科学・技術を推進するという、野依理事長が掲げる理研のミッションを強く意識しています。21世紀において、知識を社会に還元していくことは、環境・エネルギー・資源・食料・水・病気などの社
The "Token set" option returns longer names that include the search terms, e.g., hybrid taxa. See what happens if you query "Bos taurus" using the "Complete match" option versus the "Set of tokens" option. The "Phonetic search" option can be used when you are not sure about the exact spelling of a organism name. It tries to find the phonetically closest strings (try "Drozofila" as an example). Thi
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バイオインフォマティクスの一例。実験的に決定されたタンパク質のアミノ酸配列をアラインメントしたもの。 ヒトX染色体の地図。ヒトゲノム解析はバイオインフォマティクスの最大の成果の一つである。 バイオインフォマティクス(英語:bioinformatics)とは、生命科学と情報科学の融合分野のひとつであり、DNAやRNA、タンパク質をはじめとする、生命が持つ様々な「情報」を対象に、情報科学や統計学などのアルゴリズムを用いた方法論やソフトウェアを開発し、またそれらを用いた分析から生命現象を解き明かしていく(in silico 解析)ことを目的とした学問分野である。そのためバイオインフォマティクスは広義には、生物学、コンピュータサイエンス、情報工学、数学、統計学といった様々な学問分野が組み合わさった学際分野自体を指す。日本語では生命情報科学や生物情報学、情報生命科学などと表記される。 ゲノミクス研究
Toshiaki Katayama ktym****@dbcls***** 2012年 5月 31日 (木) 13:08:03 JST 前の記事 [open-bio-info 159] NGS現場の会 第二回研究会の追加募集 次の記事 [open-bio-info 161] R+Bioconductorを使ったNGS解析 記事の並び順: [ 日付 ] [ スレッド ] [ 件名 ] [ 著者 ] みなさま バイオサイエンスデータベースセンター (NBDC), ライフサイエンス統合 データベースセンター(DBCLS) では毎年 BioHackathon という国際会議を 開催してきております。 主催者側のミッションであるデータベース統合のための技術開発を目的とし、 国際的に活躍されている専門家・開発者を招聘して、国内からの参加者と いっしょに合宿形式でプログラム開発やデータの標準化などを進め
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ライフサイエンス辞書のLODは、ライフサイエンス辞書プロジェクト(URL:http://lsd.pharm.kyoto-u.ac.jp/ja/)と㈱サイバーエッヂとが共同で作成しました。 このLODの基データは、ライフサイエンス辞書プロジェクトからご提供頂いています。 ㈱サイバーエッヂが、LOD Generatorを用いて、OWLとトリプルとに変換し、LODにしたものです。 ライフサイエンス辞書のLODには、次の4種類のデータがあります。 (1).ライフサイエンス辞書の用語階層情報〔 (2).ライフサイエンス辞書の同義語情報 (3).ライフサイエンス辞書の統制語(Descriptor)情報 (4).ライフサイエンス辞書に於ける共起情報 量が多いので次の二つに分割しています。 ・共起情報パート1 ・共起情報パート2 (注意事項) ①ライフサイエンス辞書のLODのデータ
The Bio2RDF project aims to transforms silos of life science data into a globally distributed network of linked data for biological knowledge discovery. Bio2RDF creates and provides machine understandable descriptions of biological entities using the RDF/RDFS/OWL Semantic Web languages. Using both syntactic and semantic data integration techniques, Bio2RDF seamlessly integrates diverse biological
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