MPIのインストール ここでは、MPICH2のインストールについて書きます。 環境によっていろいろ違うかもしれませんが その辺は、自力でがんばってください。 他にも詳しく書いてあるサイトはありますので そのあたりのサイトと見比べながら、インストールを行ってください。 想定する環境 標準的なLinux環境を想定しています 実際に行った環境はRed Hat Enterprise Linux(RHEL) 5.4 PCは4台あり、それぞれ192.168.100.1 2 3 4と固定のIPが振られ すでにLANで接続されている状況。 SSHでの接続を行いたい場合 MPICH2のダウンロード http://www.mcs.anl.gov/research/projects/mpich2/downloads/index.php?s=downloads ここから、Sourceを落としてくる。 wgetでも
目次 >> MPI MPI(Message Passing Interface) このページでは、MPI(http://www-unix.mcs.anl.gov/mpi/)について解説する。 MPIとは MPIとは、複数の計算機で並列に計算させて、演算の高速化を図る手法である。1台のコンピュータでも可能ではあるが、通常は複数台のコンピュータをネットワークでつないだ構成を取る。1台の場合は、OpenMPなど別の方法も検討してみるとよい。 MPIはほかの並列か方法と比べて、大規模な並列化に向いているが、その一方で、実行するには特別な方法でプログラムを起動させてやる必要があるなど、少々敷居が高い。 OpenMPIとMPICHがあるが、どちらもメジャーなので好きな方を使えばよい。 OpenMPIのインストール $ sudo apt-get install openmpi-bin openmpi-d
(2008.10.8) Linux機とWindows機が混在する (ヘテロ) 環境で、並列にプログラムを動かす方法について。 並列プログラミングはいろいろな方法がありますが、ここではMPIライブラリを使ってみます。 MPI (Message Passing Interface) は、その名前のとおり、並列に動作するプログラム間で、メッセージをやり取りするための仕様です。MPI-1, MPI-2 として標準化されています。 複数の機械(ノード)を結んで、あたかも一つの計算機として計算させるために用いられます。(クラスタ) MPIは、 ブロードキャストなどデータを各ノードに配布したり集計したりする関数がある。かつ、効率のいい実装が期待できる。 RPC (Remote Procedure Call) ではない。送信データに型は付けれるが、どの関数に振り分けるかは受信側でプログラムを書かないといけ
現在、非常に眠いが、一応、世界に公開。 (案の定、 ~/.mpd.confについて書き忘れていたので、2012/MAR/10 追記したが… 普通に mpiexec を使用すると、hydra process managerなので、~/.mpd.confは不要) CentOS 6.2 (64bit)に mpich2-1.4.1p1 を入れる。 OS: Linux haruka 2.6.32-220.4.2.el6.x86_64 #1 SMP Tue Feb 14 04:00:16 GMT 2012 x86_64 x86_64 x86_64 GNU/Linux mpich2の標準パッケージをインストールしても動かないので、ソースから入れてみた。 OpenMPIは、CentOS5.5 では、すぐに動いた。 でも、今は、mpich2 を使ってみたいので、OpenMPIはあえて入れない。 mpiを使い
MPI「超」入門(C言語編) MPI「超」入門(C言語編) 東京大学情報基盤センター FOTRAN編は以下 http://nkl cc u tokyo ac jp/seminars/T2Kfvm/MPIprogf pdf http://nkl.cc.u-tokyo.ac.jp/seminars/T2Kfvm/MPIprogf.pdf Fundamental MPI 1 1 概要 概要 MPIとは • MPIとは • MPIの基礎:Hello World • 全体データと局所データ 全体デ タと局所デ タ • グループ通信(Collective Communication) • 1対1通信(Point-to-Point Communication) • 1対1通信(Point-to-Point Communication) Fundamental MPI 2 2 MPIとは (1/2) •
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