基本統計量 四則演算や初等数学関数は既に扱ったので，ここでは基本的な統計量を求める関数を紹介する．まず，10人 の患者から成る 2 グループ x，y にそれぞれ異なる睡眠薬を飲ませ，睡眠時間の増加を示すデータを準備する． x <- c(0.7,-1.6,-0.2,-1.2,-0.1,3.4,3.7,0.8,0.0,2.0) # グループ 1 の睡眠時間の増加を示すデータ y <- c(1.9, 0.8, 1.1, 0.1,-0.1,4.4,5.5,1.6,4.6,3.4) # グループ 2 の睡眠時間の増加を示すデータ

R Core Team (R-core@R-project.org ) The R Project for Statistical Computing. Lijia Yu (yu@lijiayu.net / GitHub / Twitter) A master candidate majoring in Bioinformatics at Beijing Institute of Genomics. Karl Broman (kbroman@biostat.wisc.edu / GitHub / Twitter) Department of Biostatistics and Medical Informatics, University of Wisconsin-Madison; research in statistical genetics; developer of R/qtl (

R offers a wide range of functions for cluster analysis</a >, including hierarchical agglomerative, partitioning, and model-based approaches. Although there is no definitive solution for determining the optimal number of clusters to extract, several approaches are available. Data Preparation Prior to clustering data, you may want to remove or estimate missing data and rescale variables for compara

The cowplot package is a simple add-on to ggplot. It provides various features that help with creating publication-quality figures, such as a set of themes, functions to align plots and arrange them into complex compound figures, and functions that make it easy to annotate plots and or mix plots with images. The package was originally written for internal use in my lab, to provide my students and

(Rで)塩基配列解析 (last modified 2024/07/11, since 2010) このページは、RStudio (R含む)で生命科学系のデータ解析を行うためのテンプレート集です。このページに特化したチュートリアル（インストール | についてと基本的な利用法）を一通り実践した上でご利用ください。より一般的なチュートリアルは、教科書の付録ページ(←読込に時間がかからなくなりました)にあるR1.010とR1.020で提供しています(2023/04/01)。 アグリバイオインフォマティクス、@Agribio_utokyo、アグリバイオの教科書、(Rで)塩基配列解析のサブページ What's new? (過去のお知らせはこちら) 生命科学研究のためのデジタルツール入門 第2版（監修：坊農秀雅・小野浩雅）が2024年6月末に出版されています。生命科学分野に参入してきた学生さんに、最新

Rのインストール R（アール）は統計・データ解析・統計グラフ作成のためのオープンソースソフトです。CRAN（「シーラン」または「クラン」、Comprehensive R Archive Network）のミラーサイト（日本では統数研 https://cran.ism.ac.jp/ など）からダウンロードし、インストールしてください。Windows用、Mac用、Linux用があります。 最近では下図のような RStudio（アール・スタジオ、英語の発音により忠実に書けばアール・ステューディオまたはアール・ストゥーディオ）という統合開発環境（IDE）を介してRを使う人が増えています。Download RStudio Desktop のページからダウンロードしてインストールします。 RStudio。左上ペインがソースエディタ（この図では隠れている）、左下がRコンソール、右上がグローバル環境のオブ

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