[B! bio] hidewonのブックマーク

M-CSA (Mechanism and Catalytic Site Atlas) is a database of enzyme reaction mechanisms that combines CSA and MACiE (Mechanism, Annotation and Classification in Enzymes). A new version is available here.

hidewon 2006/02/15

触媒部位予測

bio

リンク

Search CASTp database

hidewon 2006/02/15

CASTp(ポケット探索)

bio

リンク

DrugBank Online | Database for Drug and Drug Target Info

The Collaboration Between Industry and Academia in Drug DevelopmentRead Now!

hidewon 2006/02/15

Drug Bank(統合データベース)

bio

リンク

KEGG LIGAND Database

hidewon 2006/02/14

リガンドデータベース

bio

リンク

http://bioinfo-pharma.u-strasbg.fr:8080/scPDB/index.jsp

hidewon 2006/02/14

PDB検索ツール

bio

リンク

ClustalW

hidewon 2006/02/14

モチーフ解析

bio

リンク

TMHMM-2.0 - redirect

NOTE: TMHMM-2.0 is outdated. A more recent and better transmembrane predictor, DeepTMHMM, has been released and is available at https://services.healthtech.dtu.dk/service.php?DeepTMHMM.

hidewon 2006/02/14

膜貫通トポロジー予測

bio

リンク

SignalP-5.0 - redirect

New home of SignalP-5.0 is: https://services.healthtech.dtu.dk/service.php?SignalP-5.0

hidewon 2006/02/14

シグナルペプチド予測

bio

リンク

LIBSVM -- A Library for Support Vector Machines

Chih-Chung Chang and Chih-Jen Lin Version 3.33 released on July 11, 2024. We fix some minor bugs. Version 3.31 released on February 28, 2023. Probabilistic outputs for one-class SVM are now supported. Version 3.25 released on April 14, 2021. Installing the Python interface through PyPI is supported > pip install -U libsvm-official The python directory is re-organized so >>> from libsvm.svmutil imp

hidewon 2006/02/06

台湾製サポートベクターマシン

bio

リンク

http://blog.se-se.jp/2005/11/svm.html

hidewon 2006/02/06

bioinfomatics雑文

bio

リンク

http://www.bi.a.u-tokyo.ac.jp/~tak/index.html

hidewon 2006/02/06

台湾製svm

bio

リンク

http://www.immd.co.jp/product_2.html

hidewon 2006/01/17

バーチャルスクリーニング

bio

リンク

第３２回構造活性相関シンポジウム発表プログラム

hidewon 2006/01/17

バーチャルスクリーニング

bio

リンク

研究内容

hidewon 2005/11/06

Gene Ontologyを具現化してくれるＪａｖａのViewer。使いまわしがきくらしい。

bio

リンク

Kermit Murray's Website – Hosting Murray Group research, Mass Spectrometry Terms, MS Blog, and a personal blog with photography and genealogy

hidewon 2005/08/26

mass spectrometry

bio

リンク

http://www.pdg.cnb.uam.es/UniPub/iHOP/

hidewon 2005/08/03

iHOP - Information Hyperlinked over Proteins

bio

リンク

FrontPage - JAMBO (Japan EMBOSS Users Group)

オープンソースで学ぶバイオインフォマティクス † オープンバイオ研究会編による書籍「オープンソースで学ぶバイオインフォマティクス」が発売されました。EMBOSSも紹介されています。ぜひご活用ください。 ↑ 2008/7/17 Version 6.0.1 リリース † EMBOSS 6.0.0でいくつか問題が見つかったため、7/16にEMBOSS 6.0.1が緊急リリースされました。下記のURLからダウンロードできます。 ftp://emboss.open-bio.org/pub/EMBOSS/ 動作確認情報もお待ちしております。 ↑