Deleted articles cannot be recovered. Draft of this article would be also deleted. Are you sure you want to delete this article? はじめに 「100種類の学習済みモデルの性能調査をしておいて、テストデータは10種類あるよ」 こう言われた場合、作業の方法は複数ある。 1000(100 x 10)回試験を実行する。 プログラムを書いて自動化し、1回の実行で1000回試験を行えるようにする。 テストデータを1つに結合して100回試験を行い、後で10種類に戻す。 1はどんなに1回の試験に時間がかからなくてもまず選択しないだろう。プログラムに多少自身があるならおそらく2を選んだのではないか。 2を選んだ理由は「自動化できてるから待ってるだけで終わる」とか「人的ミスが減り、時
parallel NAME SYNOPSIS DESCRIPTION OPTIONS EXAMPLES SPREADING BLOCKS OF DATA TIME POSTFIXES UNIT PREFIX QUOTING LIST RUNNING JOBS COMPLETE RUNNING JOBS BUT DO NOT START NEW JOBS ENVIRONMENT VARIABLES DEFAULT PROFILE (CONFIG FILE) PROFILE FILES EXIT STATUS DIFFERENCES BETWEEN GNU Parallel AND ALTERNATIVES BUGS REPORTING BUGS AUTHOR LICENSE DEPENDENCIES SEE ALSO parallel_examples GNU PARALLEL EXAMPL
最近のコンピュータは複数のCPUコアを持っているので並列にコマンドを実行することができます。 たくさんの同じようなファイルに同じ処理を実行することは、私のやっているバイオインフォマティクスではよくあります。 しかし自分で並列に実行するスクリプトを書くことはそれほど簡単ではなく、ログや実行結果の確認など煩雑な処理を書かなければいけません。 この記事では、そうした処理を簡単にするGNU parallelというツールを紹介します。 GNU parallel UNIX系のOSではインストールはとても簡単です。MacでしたらHomebrewを使って、Linuxでは各ディストリビューションのパッケージマネージャからインストールできます。 詳しくはGNU parallelのウェブページを参照して下さい(http://www.gnu.org/software/parallel/)。 Homebrew: b
Bash Features ¶ This text is a brief description of the features that are present in the Bash shell (version 5.3, 18 May 2025). The Bash home page is http://www.gnu.org/software/bash/. This is Edition 5.3, last updated 18 May 2025, of The GNU Bash Reference Manual, for Bash, Version 5.3. Bash contains features that appear in other popular shells, and some features that only appear in Bash. Some of
# !/bin/bash from="a/" to="b/" ex="*.png" find $from -name $ex | parallel -j+0 "cjpeg -outfile $to{/.}.jpg {}" gnu parallel -j+0: 最大論理コア数で実行 {}: パイプでもらった引数(ex. a/001.png) {/.}: パイプからもらった引数をファイル名だけにして(/)さらに拡張子も取る(.)(ex. 001) そのた Q. print0とかつけなくていいの? A. よい。ユニコードだろうがスペースだろうが突っ込めば思ったとおりに'\n'デリミタで動いてくれる。parallelもcjpegも良い子。
プログラムを並列処理する GNU Parallel というプログラムがある。このプログラムの作者 Ole Tange が usenix February 2011, Volume 36, Number 1 に “The Command-Line Power Tool” という記事を書いていたので読んでみた。6ページで GNU Parallel の主要機能がひと通り解説されているので、GNU Parallel の機能をピンポイントでしか知らない人(=自分)が読むと、いろいろと使いどころが湧いて来ると思う。 GNU Parallel: The Command-Line Power Tool February 2011, Volume 36, Number 1 Authors: Ole Tange https://www.usenix.org/publications/login/februar
コマンドの並列処理を行う際、個人的にはGNU Parallelコマンドを使用するか、xargsで-Pオプションを付与するかのどちらかを使うことが多いのだが、GNU Parallelのオプションや使い方についてちゃんと調べた事がなかったので、調べてまとめてみることにする。 なお、検証に利用するGNU parallelのバージョンは以下。 blacknon@BS-PUB-DEVELOP:~$ parallel --version GNU parallel 20141022 Copyright (C) 2007,2008,2009,2010,2011,2012,2013,2014 Ole Tange and Free Software Foundation, Inc. License GPLv3+: GNU GPL version 3 or later <http://gnu.org/licen
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皆さん今日もたくさんのサーバを相手にされていることかと思いますが、いくつかのサーバにアクセスして 1 秒間の統計情報(例えばvmstat 1 2)を集めてパッと表示したい時ってどうやってますかね?shell script を学びはじめたばっかりの僕はこんな感じで書いてました。 $ for i in host1 host2 host3; do ssh $i "vmstat 1 2 | tail -1"; done 0 0 0 329004 210836 14275360 0 0 0 2424 1410 1828 0 0 100 0 0 0 0 0 3716112 587704 25921684 0 0 0 488 1643 2026 0 0 100 0 0 1 0 0 555440 265560 14015548 0 0 0 4204 1534 2392 1 0 99 0 0 vmstatと
縦分割が目的で使い始めた開発版の GNU Screen。CVS、Subversion、Gitとリポジトリを追いかけていると、他にも便利な機能があることが分かってきました。ここ半年ほど主だった変更はありませんが、4.1.0 のリリースに向けてドキュメントも整備されてきたようですので、2年ほど使用してきて分かってきた変更点をまとめようと思います。 4.1.0における変更点 ここで取り上げる変更点は次の通り。詳細は ChangeLog などを確認してください。 新しい機能 縦分割 レイアウト ウィンドウグループ マウス操作のサポート コマンドメッセージの抑止 外部からのコマンド問合せ 拡張されたコマンド/機能 最大ウィンドウ数の増加 ウィンドウ番号の相対指定 イベント発生ウィンドウの装飾設定 設定で使用可能な変数/書式の追加 ウィンドウリスト/画面リストの拡張 その他 256色サポート コマンド
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