HDDをまるごと別のHDDにコピーする場合はLinuxのddコマンドが便利です。 CDブートできるKNOPPIXからでも手軽に使えるのがいいですね。 # dd if=/dev/sda1 of=/dev/sdb1 bs=512 conv=noerror,sync "if"と"of"にはそれぞれコピー元・コピー先のデバイス名を指定します。同容量のHDDで全体をまるごとコピーする場合は物理デバイス名（"/dev/sda"）で大丈夫です。 ただ、容量などスペックの異なるHDDにコピーする場合には物理デバイスのまるごとコピーではうまくいきませんので、パーティション単位でコピーする必要があります。（物理デバイスをまるごとコピーしてもパーティションが認識できないことが多いです） その場合はまずコピー先に同サイズのパーティションをfdiskコマンド等で作成しておき、その後でパーティションを1つづつddコマ