masa_upのブックマーク (163)

  • ぷろぐらみんぐおさんぽまっぷ

    C83で配布した「ぷろぐらみんぐおさんぽまっぷ」の内容を無償公開しています。 プログラミングを学び始めた駆け出しプログラマが、これから何を学ぶべきか、どんな分野があるのかを俯瞰できるような文章です。部下や後輩を育てたいあなたにも、ぜひ読んでいただきたい内容です。 昔読んで感銘を受けたハッカーになろうの現代版(&&詳しく書いた)ともとれます。 PDFダウンロード(4MB) Webページ

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    masa_up 2013/01/06
    プログラミングを学び始めた駆け出しプログラマが、これから何を学ぶべきか、どんな分野があるのかを俯瞰できるような文章です。
  • 自己編集スキルを身につければ、文章は見違えるほど良くなる! | ライフハッカー・ジャパン

    筆者のCaroline McMillan氏は、ノースカロライナ州シャーロットのローカル新聞『The Charlotte Observer』の記者として、スモールビジネスやアントレプレナーの記事を執筆しています。McMillan氏はノースカロライナ大学チャペルヒル校でジャーナリズムを専攻、在学最後の2年間をデューク大学とUNCの共同出版雑誌「Rival Magazine」の主任編集者として過ごしました。今回はMcMillan氏が「よい文章のための自己編集スキル」について語ります。 多くの新聞記者と同様、私は「書くことが好き」で、「書くことが得意」なので、この仕事につきました。しかし、記者というのは厳しい職業です。あなたが最高傑作だと思う記事を提出しても、編集者から20カ所ものダメ出しが返ってきます。 それでも、そんなことを200回も繰り返せば、すっかり面の皮が厚くなります。また、「自己編集能

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    masa_up 2013/01/05
  • インスピレーションを刺激しまくる「最強」Webサイト10選

    こんにちは。 何かで立ち止まったり、行き詰まったりした時はインスピレーションを得ると解決することがあります。 そんな時に訪れる、普段から利用しているWebサイトを集めてみました。 1、S5-Style レベルの高いWebデザインのギャラリーサイトです。 このサイトの運営者がウェブサイトを紹介しています。センスがいい。 2、FFFFOUND! ウェブで見つけたお気に入り画像をメモって、シェアするサイトです。 ロゴからフォトグラフィまでなんでもあり。アーティスト向けでインスピレーションが湧きまくります。 3、Creattica フォントやアイコン、ロゴ、名刺など色々参考になるギャラリーサイトです。 インスピレーションを向上させたいときはこのサイト。 4、Twitter 名言 文字で見せるサイト。 Twitter上でつぶやかれた名言を集めています。 デザインが秀逸でインスピ

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    masa_up 2013/01/04
    プレゼン素材
  • フリーのアイコン素材サイト7選(登録なしですぐに使える)

    ロゴやfavicon、バナー制作などで活躍するアイコン素材。世の中には、アイコン素材を無料でダウンロードできるサイトは多数ありますが、登録が面倒だったり有料素材にすぐに誘導されるサイトが多かったりします。 今回ご紹介するのは、登録の手間もなくほしい素材をすぐに検索してダウンロードできるフリーのアイコン素材サイトです。 ダウンロードできる素材の形式としては、ico、pngを中心に、JPEG、GIF、PSD、AIなどの形式があるもの(ベクター素材もあり)、商用利用かどうかをライセンスを指定して検索できるサイト、「動物」「ビジネス」「かわいい」など用途に応じたカテゴリにわけたサイトまで幅広く揃えました。 フリーのアイコン素材サイト 無料でダウンロードできる8つのアイコン素材サイトを順番にご紹介します。ico、png 形式が中心ですが、それ以外の形式もあるので自分にあった素材のものを探してみてくだ

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    masa_up 2013/01/04
    プレゼン素材
  • 【最新版】すべて無料!おすすめのフリーの画像&写真素材サイト20選【商用利用可能】

    「Webサイトや記事、プレゼン資料などできれいな画像や写真を使用したい」 と思ったときに真っ先に思い浮かぶのはフリー画像や写真素材ですよね。 画像や写真は見た人の印象にも残りやすく、デザインを洗練させる役割も大きいものです。 またブログやメディアではアイキャッチにこだわることで、記事を読んでもらうきっかけを作りやすくなります。 一方で、イメージに合った画像を探すことはどうしても時間をとられがちです。 また、フリー素材を使用するには、利用規約を読むのが難しかったり、商用利用は大丈夫なのか確認したりと大変な作業が多いです。 そこで今回は、国内外問わず、無料かつ商用利用も可能な写真&画像素材が見つかるフリー画像、素材サイトをまとめてみました。 全て商用利用可能で、クレジット表記や改変が可能かも分かりやすく記載しています。 この記事を読めば、数多くのフリー画像サイトの中から、できるだけ最短でイメー

    【最新版】すべて無料!おすすめのフリーの画像&写真素材サイト20選【商用利用可能】
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    masa_up 2013/01/04
    プレゼン素材
  • 【旧版】Ruby入門 (全32回) - プログラミングならドットインストール

    旧版のレッスンは更新を終了しており、現状と異なる場合があります。サポートも終了しておりますので、最新版への移行をお願いします。

    【旧版】Ruby入門 (全32回) - プログラミングならドットインストール
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    masa_up 2013/01/04
    動画でRubyの勉強
  • 【無料】集中したいときに!おすすめの作業用BGMサービスまとめ

    何かの作業に集中する際に「音楽」や「音」は大切な要素です。 そこで今回は無料で聴けて、さらに作業用BGMとしても使えるとっておきのWebサービスやアプリをご紹介します。 noisli Noisliは、雨音やノイズなど、の環境音が聴けるサービスです。 BGMは「雨」「雷」「風」「森」「葉」「川」「波」「水」「火」「虫の声」「カフェ」「電車」「風車」「ホワイトノイズ」「ピンクノイズ」「ブラウンノイズ」の16種類。 環境音を単体で聴くのはもちろん、音同士を重ねたり、音量も調節できるので自分だけの環境音BGMをつくることができます。 またランダム、生産性、リラックスなどのテーマもあり、自分で決められない人はそのボタンをクリックするだけで、そのテーマにあった環境音ができあがります。 → noisli またNoisliはiOSアプリにも対応しており、下記からダウンロード(240円)できます。 → iP

    【無料】集中したいときに!おすすめの作業用BGMサービスまとめ
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    masa_up 2013/01/04
    作業用BGM
  • Lab Protocols

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    masa_up 2012/12/28
    進化研究をやってるBig Lab David Kingsleyのラボのプロトコル
  • Protocol Online - Your lab's reference book

    Animal Techniques Surgery, Xenograft Tumor Models Biochemistry Amino Acids & Protein, Lipid... Bioinformatics & Biostatistics Database Search, Sequence Analysis... Cell Biology Apoptosis, Cell Culture, Stem Cells, Signal Transduction... Developmental Biology Embryology, Fertilization... Essential Data MW Markers, Restriction Enzymes... General Lab Techniques Centrifugation, Quantitation... Genetic

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    masa_up 2012/12/28
    オンライン生物学プロトコル集
  • DAVID Functional Annotation Bioinformatics Microarray Analysis

    The Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery (DAVID) provides a comprehensive set of functional annotation tools for investigators to understand the biological meaning behind large lists of genes. These tools are powered by the comprehensive DAVID Knowledgebase built upon the DAVID Gene concept which pulls together multiple sources of functional annotations. For any given ge

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    masa_up 2012/12/28
    マイクロアレイ解析などで、見つけた重要な遺伝子群がどのようなアノテーションなのかを簡単に調べられる how to use http://www.youtube.com/watch?v=WIfe7Z_Mvxg
  • まとめ

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    masa_up 2012/12/28
    ENCODEの情報をわかりやすくまとめてる
  • GenomicRanges

    To install this package, start R and enter: ## try http:// if https:// URLs are not supported source("https://bioconductor.org/biocLite.R") biocLite("GenomicRanges") In most cases, you don't need to download the package archive at all. This package is for version 2.11 of Bioconductor; for the stable, up-to-date release version, see GenomicRanges. Representation and manipulation of genomic interval

    GenomicRanges
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    masa_up 2012/12/28
  • easyRNASeq: a bioconductor package for processing RNA-Seq data

    1Genome Biology Computational Support and 2Genome Biology Unit, European Molecular Biology Laboratory, Meyerhofstrasse 1, 69117 Heidelberg, Germany

    easyRNASeq: a bioconductor package for processing RNA-Seq data
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    masa_up 2012/12/28
    .bamとannotation情報をまとめる為のBioconductorパッケージ
  • 幹細胞の多能性を規定する分子機構 : ライフサイエンス 領域融合レビュー

    2012年12月11日 丹羽 仁史 (理化学研究所発生・再生科学総合研究センター 多能性幹細胞研究プロジェクトemail:丹羽仁史 領域融合レビュー, 1, e008 (2012) DOI: 10.7875/leading.author.1.e008 Hitoshi Niwa: Molecular mechanism governing pluripotency of stem cells. 要 約 マウスの着床前の胚から樹立されたマウスES細胞は,サイトカインのひとつLIFに依存的に多能性を維持している.このLIFシグナルは複数の転写因子の制御を介し多能性に関連する転写因子ネットワークに入力している.これとは並列に,液性タンパク質であるWntも多能性の維持に寄与するが,このWntシグナルはTcf3によるEsrrb遺伝子の発現抑制を解除するというひとつの点において多能性に関連する転写因

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    masa_up 2012/12/27
  • Argonaute:RNAサイレンシングの構造基盤 : ライフサイエンス 領域融合レビュー

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    masa_up 2012/12/27
  • こわくない Git

    8. コミットに入ってる情報 リビジョン (SHA-1 ハッシュ) 例: 23cdd334e6e251336ca7dd34e0f6e3ea08b5d0db Author (コミットを作成した人) 例: オープンソースプロジェクトにパッチを送った人 Committer (コミットを適用した人) 例: 受け取ったパッチを取り込んだ人 ファイルのスナップショット (tree) コミットで変更されたファイルを含むツリー(説明は省略) 1つ前のコミットのリビジョン 例: 4717e3cf182610e9e82940ac45abb0d422a76d77 9. コミットに入ってる情報 リビジョン (SHA-1 ハッシュ) 例: 23cdd334e6e251336ca7dd34e0f6e3ea08b5d0db Author (コミットを作成した人) 例: オープンソースプロジェクトにパッチを送った人 Co

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    masa_up 2012/12/27
  • デザイナーの私が色選択に迷った時に使用している配色ツール・カラーチャートなどのまとめ

    New/ old tin palette / jessiecchapman 「色彩検定2級」と言う自慢していいんだかよくわからない資格を持っている私。…が、デザイン会社勤務でありながら、どうも「色使い」と言うものに苦手意識を持っておりまして。 いざデザインに取り掛かろう!となってからメインカラーを決めて、サブのカラーを決めて、よしこれだ、あ、でも待って、こっちの色の方がいいかも、ううん、元に戻そう…あ、やっぱりこのキャミソールにしようかしら…etcetc。 さっぱり作業が進まないこともしばしばなのですが、そんな時に使用しております配色の手助けツールをまとめておきたいと思います:)

    デザイナーの私が色選択に迷った時に使用している配色ツール・カラーチャートなどのまとめ
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    masa_up 2012/12/27
  • Wiley: TED Studies: Statistics - Visualizing Data

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    masa_up 2012/12/27
  • 次世代解析の特に比較に便利なRパッケージ: DEseq | したっぱ昆虫細胞研究者のメモ

    次世代シーケンスデータの解析には、配列情報を扱うものと、それに引き続く数値(発現量とか)を扱う段階がありますが、後者の方はまだあんまり王道がないです(と思ってます)。 mRNA-seqの発現比較方法として、Z検定を用いたもの、GLMを用いたものなんかがありますが、パッケージになってないと使い方分からないし、正規化の方法も何やってんだかわからないです。 Rのパッケージで使ってみて良さそうなのがあったのでメモメモ Simon Anders* and Wolfgang Huber Differential expression analysis for sequence count data Genome Biology 2010, 11:R106 いつもお世話になってる門田先生のHP(Rで)塩基配列解析(主に次世代シーケンサーのデータ) by 門田幸二でDEGseqっていうパッケージとDEse

    次世代解析の特に比較に便利なRパッケージ: DEseq | したっぱ昆虫細胞研究者のメモ
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    masa_up 2012/12/27
  • オーソログDB Inparanoidの使い方

    Inparanoidは、スウェーデンのストックホルムバイオインフォマティクスセンター(SBC)が提供するオーソログのデータベースで、17種類の生物についてそれぞれのオーソログ遺伝子/タンパク質を調べることができます。今回の動画では、Inparanoidで使うことのできる4つのオーソログ検索方法について紹介します。 見どころダイジェスト 1. Inparanoidへの行き方(17秒) 2. Browse機能の使い方(45秒) 02:12 3. オーソログの詳細ページの解説 04:23 4. Gene search機能の使い方 06:11 5. Text search機能の使い方 07:35 6. Blast機能の使い方

    オーソログDB Inparanoidの使い方
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    masa_up 2012/12/27