分子動力学計算結果の可視化などに用いられるプログラムVMD - Visual Molecular Dynamicsは Linux版、MacOS版、Windows版 が配布されています。 なんだかんだでWindows版が一番使いやすいのですが、残念ながらWindows版は32bit版であり、64bit OSであっても利用できるメモリ上限が2GBに制限されてしまっています。 そのため、大きなデータを読み込むとメモリ不足に由来すると思われるエラーで落ちてしまいます。 メモリ不足によるエラーメッセージ winvmdは動作を停止しました 根本的には64bit版が公開されるのを待つしかないのですが、ちょっとした操作をすることで利用できるメモリを倍の4GBまで増やすことが可能です。 参考:64bit Windowsを前提とした32bitアプリケーション延命法 ~ LAAオプションで32bitアプリケーシ
![windows版VMD(32bit)の利用できるメモリ量を2GBから4GBに増やす - 生物物理計算化学者の雛](https://cdn-ak-scissors.b.st-hatena.com/image/square/91f02c6a5fd45322f2b4cf2793a03a062e529287/height=288;version=1;width=512/http%3A%2F%2Fcdn-ak.f.st-hatena.com%2Fimages%2Ffotolife%2Fm%2Fmasa_cbl%2F20140301%2F20140301222454.png)