コマンドを並列に実行するGNU parallelがとても便利 - りんごがでている
最近のコンピュータは複数のCPUコアを持っているので並列にコマンドを実行することができます。 たくさんの同じようなファイルに同じ処理を実行することは、私のやっているバイオインフォマティクスではよくあります。 しかし自分で並列に実行するスクリプトを書くことはそれほど簡単ではなく、ログや実行結果の確認など煩雑な処理を書かなければいけません。 この記事では、そうした処理を簡単にするGNU parallelというツールを紹介します。 GNU parallel UNIX系のOSではインストールはとても簡単です。MacでしたらHomebrewを使って、Linuxでは各ディストリビューションのパッケージマネージャからインストールできます。 詳しくはGNU parallelのウェブページを参照して下さい(http://www.gnu.org/software/parallel/)。 Homebrew: b
JuliaTokyo #1 を開催しました - りんごがでている
日本で(多分)最初のJuliaの勉強会 JuliaTokyo #1 を開催しました。イベントページはこちらです。 http://juliatokyo.connpass.com/event/6891/ 当日は40人ほどの参加者が集まり、いつの間にJuliaがそんなに一般化したんだという感じでしたが、Julia歴1週間とか当日の朝から始めましたというように、何処からかJuliaが熱いらしいとの噂を聞きつけてJuliaを使ってみようという新しいもの好きの人たちが多い印象でした。 私はパッケージの作り方についてお話をしてきた次第です。 以下は、それぞれの発表と私のひとこと感想です。 メインセッション Juliaのこれまでとこれから - @sorami Juliaの背景的な情報やどんなエコシステムになっているかを紹介していました。 JuliaはPythonやRからユーザを取り込みつつ、共に進化してい
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