Projects:OrthologGroup - KazusaWiki
2009.9 eggNOG OC@KEGG 東大中谷さんによるクラスタリングプログラム The OMA Orthologs Matrix Project (OMA) The orthologs matrix project (OMA) is based on a massive cross-comparison of complete genomes that is currently performed by the CBRG group. This allows us to identify orthologous genes. The orthologs matrix project started in summer 2004 and since then over 300 CPUs are performing the enormous task of comparing who
SemanticWebServices – BioHackathon 2009
Semantic web services Participants Paul Luke Mark Rutger Nik Martin Jessica Tom Pierre José María Alberto Yulia Yunsun Bruno Toshiaki Introduction The holy grail of web service interoperability is hampered along three axes: syntax, semantics and interface. In terms of core data syntax, bioinformatics tools consume and produce data in many different formats, some of which are loosely defined syntac
Oligo/BAC CGH Array 解析パッケージをまとめてみる - 気の向くままに
書きかけです‥下書きで保存すると結局公開しないことが多発するので。 また来週に改訂するつもり。 目的・動機 今回は普段自分が使っていないプラットフォームの CGH マイクロアレイを解析 & 自分の実験データと比較するために、他社のプラットフォームを解析するためのツール (パッケージ) をここに集めておく *1。 対象とするのは BAC とアジレント社製の CGH アレイ。# だったけど Affy と共用のものもある 背景 今やっている研究では Affymetrix 社製の GenomeWideSNP 6.0 array というアレイを用いて染色体の構造異常を解析している。 また最近になって各種の精神疾患で多くの染色体構造異常が報告されまくっている*2。そしてこれらデータは論文で発表されるとともに NCBI GEO でも利用可能になっている (ものもある)。 ここからパッケージたち cghM
zuzara.com » 日本で公開されているAPI一覧（下書き）
追記：清書としてusing API;でAPIに関するブログをはじめました。 「ProgrammableWeb: Web 2.0 Mashup Matrix」には海外のAPIがずらりと並んでいますが、日本語圏のAPIの最新のリストは見当たらなかったので集めてみました。 Nakamura-KU ADDICT <>invGeocoder のREST 緯度経度を引数に住所を返す写真共有「フォト蔵」Geocoding API – 住所から緯度経度を検索RSSナビ –開発者の方 (RSSナビ RSET API)Simple API – ウェブサイト・サムネイル化ツールlivedoor PICS WebService – livedoor PICS サービスのお知らせ – livedoor Wiki（ウィキ）ヨコナビ – livedoor ReaderのAPI一覧Weather Hacks – live
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