Oligo/BAC CGH Array 解析パッケージをまとめてみる - 気の向くままに

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Oligo/BAC CGH Array 解析パッケージをまとめてみる - 気の向くままに

書きかけです‥下書きで保存すると結局公開しないことが多発するので。また来週に改訂するつもり。目的... 書きかけです‥下書きで保存すると結局公開しないことが多発するので。また来週に改訂するつもり。目的・動機今回は普段自分が使っていないプラットフォームの CGH マイクロアレイを解析 & 自分の実験データと比較するために、他社のプラットフォームを解析するためのツール (パッケージ) をここに集めておく *1。対象とするのは BAC とアジレント社製の CGH アレイ。# だったけど Affy と共用のものもある背景今やっている研究では Affymetrix 社製の GenomeWideSNP 6.0 array というアレイを用いて染色体の構造異常を解析している。また最近になって各種の精神疾患で多くの染色体構造異常が報告されまくっている*2。そしてこれらデータは論文で発表されるとともに NCBI GEO でも利用可能になっている (ものもある)。ここからパッケージたち cghM

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