SassなどのCSSプリプロセッサやAutoprefixerのようなポストプロセッサを利用すると、プロセッサ規定のインデントや改行方法でCSSが整形されます。これについては@myakuraさんがAutoprefixer ― CSSのベンダー接頭辞をいろいろする - fragmentaryの最後で懸念事項として上げられていましたし、僕も2011年の年末にSassで出力するCSSファイルを自社のCSS記述ルールに合わせるヒントで、Sassをカスタマイズして解決する方法を紹介したりもしました。 Autoprefixerのdependenceであるpostcss(Framework for CSS postproccessors)を見ると、Whitespacesという項があり、インデントやスペースを調整できることが解説されています。これを利用すれば、CSS Beautifyのようなことがオフライン