【Rメモ】多変数の関係性を視覚化する関数（パッケージ）まとめ - Qiita自分の覚書的な意味合いも含め、Rで多変数からなるデータフレームの関係性を視覚化する 関数（パッケージ）をまとめます。 多変数視覚化パッケージ＆関数まとめ pairs：散布図行列 既定で利用できるpairs関数。 見やすく加工するには色々パラメータをいじる必要があります。
Practical R Package Development (Japanese)
Practical R Package Development (Japanese) Hiroaki Yutani 2019-02-11 はじめに Rのパッケージ開発については「R Packages」（Hadley Wickham、2015）に詳しいが、Rのパッケージ開発にはここ数年で様々な変化があった。 幸い、同書は第2版に向けて大幅に書き直される予定1なので、賢明なRパッケージ開発者はそれを待つのがいいだろう。本書は、あくまでもそれまでのつなぎのような存在として、むしろ筆者のメモ代わりとして、衝動的に書き殴られたものだ。Rパッケージ開発の基礎はすっとばし、新たなトピックを中心に取り扱う。信用がおける知識についてはあくまでも「R Packages」を参照されたい。
Great R packages for data import, wrangling, and visualization
The table below shows my favorite go-to R packages for data import, wrangling, visualization and analysis — plus a few miscellaneous tasks tossed in. The package names in the table are clickable if you want more information. To find out more about a package once you’ve installed it, type help(package = "packagename") in your R console (of course substituting the actual package name ). My favorite
多次元時系列の異常検知手法 sGMRFmix について /sGMRFmix - Speaker Deck
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データ系列が多すぎるとき、いい感じに一部をハイライトするためのパッケージgghighlightをつくりました - Technically, technophobic.
ggplot2で可視化しようとして、データ系列が多すぎてこんなもじゃもじゃになってしまう、みたいなことないでしょうか。 これを、一部だけを色付けしてこんな感じのプロットにしてくれるパッケージをつくりました。 インストール GitHub上からインストールできます。 devtools::install_github("yutannihilation/gghighlight") gghiglightがやっていること gghiglightの説明をする前に、まずは上のグラフが何をしているのか、まずはふつうのtidyverseでやってみます。 データはこんな感じのやつです。 library(dplyr, warn.conflicts = FALSE) set.seed(1) d <- tibble( idx = 1:10000, value = runif(idx, -1, 1), type = sa
[R] 非ガウシアン状態空間対応パッケージ, KFAS の使い方 - ill-identified diary
概要 まだ日本語情報の少ない KFAS を一連の状態空間モデルネタの続きとして紹介する. KFAS には一番良く使われている dlm パッケージよりも優れた点がいくつもある. 前回のように, パッケージの理念・構文・具体例を用いた実験を順に紹介していく. 状態空間モデルを扱う Rパッケージの中では dlm が最も有名だが, これは名前の示すように動的線形モデル dynamic linear model, すなわちノイズが正規分布になる, ガウシアン線形状態空間モデルしか扱うことができない. これに対して KFAS の長所はいくつもあり, 特に正規分布いがいの分布も扱うことができるという点は特筆すべきである. なお, KFAS を日本語で紹介している文献は, 伊東先生の発表スライド, Rパッケージ“KFAS”を使った時系列データの解析方法 from Hiroki Itô 伊東 (2017,
![[R] 非ガウシアン状態空間対応パッケージ, KFAS の使い方 - ill-identified diary](https://cdn-ak-scissors.b.st-hatena.com/image/square/55dde84011f89d2bb3b373c108a980d209ee20e8/height=288;version=1;width=512/https%3A%2F%2Fcdn-ak.f.st-hatena.com%2Fimages%2Ffotolife%2Fi%2Fill-identified%2F20180811%2F20180811000928.png)
Rおじさん、Pythonistaになる - cucumber flesh
こちらをご覧ください。踏み絵ではありません。R上で地理空間データを扱うPythonモジュール、geopandasによる作図を行なっている画面です。 え、RでPythonを!?と驚かれる方もいるかもしれませんが、reticulateというRパッケージを使うことで、ほぼストレスフリーでPythonのモジュールや関数がR上で利用可能になります。先の図は次のコードによって実行されました。 library(reticulate) # モジュールの呼び出し gpd <- import("geopandas") plt <- import("matplotlib.pyplot") # サンプルデータの読み込み world <- gpd$read_file(gpd$datasets$get_path("naturalearth_lowres")) # データセットの確認 head(world) # ではな
DJタカヤナギ=サンで学ぶRを用いた画像操作 ·
こんにちは、ホクソエムの市川です。 日々の業務の合間にちょっとクソコラを作りたいこと、あると思います。 でもクソコラに手間はかけたくない。 そんな時に使えるのがimagerパッケージです。 ちなみに画像操作に使えるRのパッケージには他にもEBImageパッケージ、magickパッケージ等があります。 それぞれに利点はあるのですが、EBImageはbioconductorからインストールする必要があるので手間がかかり、magickは画像の上に図形を描くのが意外と面倒だったりします。 繰り返しますがクソコラに手間はかけたくない。 ということで今回はCC0ライセンスで公開されているDJタカヤナギ=サンの画像を用いてimagerパッケージの使い方について学びたいと思います。 画像の読み込みと表示 画像の読み込みにはload.image()を用います。 読み込んだ画像の情報はprint.cimg()
Bayesplotパッケージはいいよ
ベイズの話があちこちで盛り上がっていますね！ ところで，ベイジアン・モデリングで得られた結果を表現する切り口っていろいろあるのですが，これを一手に引き受けてくれる便利なパッケージ，bayespotの存在を知りました。 これまではshinystanでみると綺麗！だったのですが，ブラウザが立ち上がるのでちょっと面倒。bayesplotパッケージはplot領域に出力されるし，結果がggplot2オブジェクトなので，ggplot2のレイアを上書きして言ったりすることができるのも便利。 ということで，練習がてら挙動を確認してみる。 まずは簡単なモデルを書いてみることに。 # ライブラリの読み込み library(rstan) ## 要求されたパッケージ ggplot2 をロード中です ## 要求されたパッケージ StanHeaders をロード中です ## rstan (Version 2.14.1
{forcats}パッケージでカテゴリカル変数(factor型データ)をいじってみる
tidyverseパッケージ群のひとつで，カテゴリカル変数(Factor型データ)をいじるのに特化したものとしてforcatsパッケージがあります。開発の経緯や詳細はパッケージの公式サイト，および「R for Data Science」のFactorsの章をご覧ください: Tools for Working with Categorical Variables (Factors) • forcats 15 Factors - R for Data Science 今回は，公式サイトの関数リファレンスを参考に，自分向けのメモがてらテストします。 インストール CRANに登録済み。また，tidyverseパッケージ群なのでtidyverseをインストールすることでも可能。 # {tidyverse}をインストールすれば自動的にインストールされます: install.packages("tidy
miniCRAN で Azure Machine Learning 用のリポジトリーを作る - 捨てられたブログ
本記事は R Advent Calendar 2016 に参加しています。 Azure Machine Learning（Azure ML）を使うと、分析処理を容易に WebAPI 化することができて便利です。分析モジュールは細分化することができ、 R や Python で処理を記述することができます。 R Advent Calendar なのでもちろん R の話です。 R で処理を行う際に、自作他作問わず様々なパッケージを導入する必要がありますが、 Azure ML だとパッケージの導入は少し手間がかかります。というのは Azure ML の分析モジュールではインターネットアクセスを行うことができず、 `install.packages` 関数や `devtools` パッケージの install 系関数では単純にパッケージをインストールすることができないからです。 ではどうするかという
Community-contributed libraries - Getting Started
In addition to the officially supported drivers, you can find their Community alternatives. Besides Java, .NET, JavaScript, Go, and Python drivers, Neo4j Community offers support for Ruby, PHP, and Perl. Links to their relevant resources are provided below. Members of the each programming language community have invested a lot of time and love to develop each one of the community drivers for Neo4j
🍭ホクソエムのつながりをNeo4Jを使って確かめる - cucumber flesh
先日、Neo4Jというオープンソースで開発されるグラフデータベースの存在を知りました。恥ずかしながら、グラフデータベース？なにそれ美味しいの？という知識しかありませんでしたが、どうやらNoSQL（リレーショナルデータベースだけがデータベースではない）の流れを組んで誕生したものらしいです。グラフデータベースは、表形式で表現されるリレーショナルデータベースに対して、データ間の関係性を表現するのに向いています。 気になるものがあるとすぐにRパッケージを探し出してしまう性分なので調べてみると、すぐに {RNeo4j}というパッケージが見つかりました。というわけでこの{RNeo4j}パッケージを使ってNeo4Jの扱いについて慣れていこうというメモです。 今回は適当な例として来月に結成１周年を迎える匿名知的集団「ホクソエム」のメンバー間のTwitter上でのフォロー状況について整理してみることにします
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Packrat: パッケージ管理入門
Automating roxygen2 package documentation | R-bloggers
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CRAN - Package VBmix
vbgmm: Variational Bayesian Gaussian mixture model (VB-GMM) in TargetScore: TargetScore: Infer microRNA targets using microRNA-overexpression data and sequence information
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