はじめに これは、3回にわけて Wu らによる O(NP) アルゴリズムを解説、実装するシリーズです。 ①仕組み、考え方 ②探索方法 <- 今回 ③Goによる実装 の3部に分かれています。 今回も、前回に引き続き Wu らによる O(NP) アルゴリズムの解説をしていきたいと思います。 前回の ①仕組み、考え方編 では、大まかな考え方を整理して、なぜ計算量が下がるのかわかりました。 今回は、前回わかったことを利用して、実際にどう探索していくのかまとめていきます。 元論文は An O(NP) Sequence Comparison Algorithm by described by Sun Wu, Udi Manber and Gene Myers です。興味のある方はそちらも目を通すと面白いと思います。 最終的な実装を確認したい方は https://github.com/convto/on
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