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2008年7月29日のブックマーク (2件)

  • よくある質問

    PDBに関するよくある質疑応答をまとめました。 1. PDBとはなんですか? 2. PDB IDとはなんですか? 3. 蛋白研ではどんなサービスを行っていますか? 4. どうやって検索出来ますか? 5. 利用は誰でもできますか? 6. PDBファイルの見方を教えて下さい。 7. どうやって登録すればいいか教えて下さい。 8. 公開されているデータ全部を取得したいのですがどうしたらいいですか? 9. CD-ROMを入手するにはどうしたらいいですか? 1. PDBとはなんですか? 生体高分子は多数の原子を含んでいるため、膨大な量の座標を雑誌に直接掲載することができません。Protein Data Bank(PDB)はこのような生体高分子立体構造の座標と解析パラメーターなどのデータの編集、公開をWEBとftpで行っています。平成14年7月で約1万8千件のエントリーがありま

    romans12
    romans12 2008/07/29
  • http://www.jaist.ac.jp/~m-hatake/gromacs/howtogromacs.txt

    How to GROMACS(Last update:20070124) Masaomi Hatakeyama 20041005 the beginning to write * Contents * Chap0 はじめに * Chap1 心の準備 * Chap2 GROMACSインストール * Chap3 GROMACS概要 * Chap4 GROMACS詳細その1 demo * Appendix GIFアニメーションの作り方 * Appendix .xvg(xmgrace用)ファイルをgnuplot用ファイルに変換するスクリプト * Appendix g_rotacf * Appendix Put in the wall * Appendix トラジェクトリーファイル(traj.trr)を連結する。 * Appendix 途中でプログラムが止まった時は、、、