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A Pattern Language Towns, Buildings, Construction By Christopher Alexander, Sara Ishikawa and Murray Silverstein with Max Jacobson, Ingrid Fiksdahl-King and Shlomo Angel Oxford University Press, 1977. 1141 pages. Buy Now on Amazon.com For Kindle "There is one timeless way of building. It is thousands of years old, and the same today as it has always been. The great traditional buildings of the pas
ペアワイズアラインメントに関する調査報告
ペアワイズアラインメントに関する調査報告 永松 秀人, 廣安 知之, 三木 光範 ISDL Report No. 20030608005 2003年 9月 2日 Abstract 本レポートは相同性検索の最も必須の技術である, ペアワイズアラインメントについての調査報告である. アラインメントは, 2つの配列を要素ごとに対応づける操作により行われる. そのため, 要素の対応を記述したスコアモデルと, 挿入・欠失を定義したギャップペナルティの定義が必要となる. 一般的に, スコアモデルには対数尤度比をもとに作成したBLOSUMやPAM行列が用いられ, ギャップペナルティには, アフィンギャップペナルティが用いられる. これらを用いたアラインメントは大別すると, ローカルアラインメントとグローバルアラインメントの2種類に分けることができ, それぞれ動的計画法を用いた解法がすでに提案され
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