2016年3月2日のブックマーク (10件)

  • Kallisto, a new ultra fast RNA-seq quantitation method

    You are here: Home / RNA-Seq / kallisto / Kallisto, a new ultra fast RNA-seq quantitation method [Update:] Since the post was published, a preprint on Kallisto manuscript is available. Lior Pachter has writtena blog post on pseudo-aligments and Rob Patro has a nice post on “Light weight algorithms for RNA-seq”. Here there. kallisto preprint Near-optimal RNA-Seq quantification with kallisto Rob Pat

    Kallisto, a new ultra fast RNA-seq quantitation method
  • Open-bio.jp

    オープンバイオ研究会 オープンソースのバイオインフォマティクスプロジェクトを推進 英名 Japan Open Bioinformatics Research Group 通称 Open Bio Japan 略称 (O|B|J) See wiki for details. 目的 海外では、BioPerl, Biopython, BioJava, EMBOSS などバイオインフォマティクス用のソフトウェア開発プロジェクトを円滑に推進するために Open Bio Foundation (OBF) が重要な役割を果たしており、これらのソフトウェアを含む数多くのオープンソースソフトウェアがアカデミック/コマーシャルを問わず広く使われています。しかし、国内ではこれらのプロジェクトに関わっている開発者が少ないことや、日語ドキュメントの不足からか、まだ十分には活用されていませんし、国際的にも貢献が足りな

    sayamatcher
    sayamatcher 2016/03/02
    長いブランクを経て、今回かなり久しぶりにオープンバイオ研究会@JAIST、参加します。皆さんも、是非!
  • 第一回オープンバイオ研究会

    sayamatcher
    sayamatcher 2016/03/02
    スキーウェア着てプレゼンとか、浴衣の下にゲノムネットTシャツ着ているとか、ネタ満載やな、おいら…
  • Open-bio.jp

    オープンバイオ研究会 オープンソースのバイオインフォマティクスプロジェクトを推進 英名 Japan Open Bioinformatics Research Group 通称 Open Bio Japan 略称 (O|B|J) See wiki for details. 目的 海外では、BioPerl, Biopython, BioJava, EMBOSS などバイオインフォマティクス用のソフトウェア開発プロジェクトを円滑に推進するために Open Bio Foundation (OBF) が重要な役割を果たしており、これらのソフトウェアを含む数多くのオープンソースソフトウェアがアカデミック/コマーシャルを問わず広く使われています。しかし、国内ではこれらのプロジェクトに関わっている開発者が少ないことや、日語ドキュメントの不足からか、まだ十分には活用されていませんし、国際的にも貢献が足りな

    sayamatcher
    sayamatcher 2016/03/02
    JAIST行くの、この第1回オープンバイオ研究会以来、11年ぶりと判明w
  • OBF » BOSC 2016 Call for Abstracts » BOSC 2016 Call for Abstracts

  • ポンチ絵(ポンチエ)とは? 意味や使い方 - コトバンク

    1 風刺や寓意を込めた、こっけいな絵。漫画。 2 概略図。構想図。製図の下書きとして作成するものや、イラストや図を使って概要をまとめた企画書などのこと。 [補説]1は、英国の風刺漫画雑誌「パンチ(Punch)」からとも、またはこれにならって文久2年(1862)ごろに英国人ワーグマンが横浜で発刊した漫画雑誌「ジャパン‐パンチ(The Japan Punch)」からともいう。

    ポンチ絵(ポンチエ)とは? 意味や使い方 - コトバンク
  • 「情報の科学と技術」2016年3月号 (66巻3号). 特集= 研究倫理

    特集:「研究倫理」の編集にあたって 2015年度の最後となる特集は「研究倫理」です。 “科学(学術)情報流通における倫理問題は,実に古くて新しい問題である。問題の現象面に関しては,発生するたびに新聞などの媒体でも報じられているので,ことさら言及する必要はなかろう。問題は,情報技術の進化と共に科学情報流通の速度が急激に速まり,日常生活の様々な側面に影響を及ぼす速度が速くなり,大なり小なり影響を蒙る。~中略~ 我々は不正を単に倫理的に断罪すれば良いのであろうか・・・” (紙2001年12月号:特集「科学情報の倫理」前書きより) 前回の関連特集からはや15年近くが経ち,ICT技術の発展により研究活動は大きくその様相を変えています。インターネットのさらなる普及と研究情報のオープン化が進むなか,問題は国境や専門分野を越えてより複雑に,より深化しつつあるように見受けられます。年1月に閣議決定された

    「情報の科学と技術」2016年3月号 (66巻3号). 特集= 研究倫理
    sayamatcher
    sayamatcher 2016/03/02
    “「情報の科学と技術」2016年3月号 (66巻3号). 特集= 研究倫理”
  • 近江屋洋菓子店

    【営業時間】 月~土 9:00 ~ 19:00 日祭日 10:00 ~ 17:30 年中無休 ※年末年始の休業・営業時間はお問い合わせ下さい。 ※喫茶は休業中となります。

    sayamatcher
    sayamatcher 2016/03/02
    ここのアップルパイをいただきました
  • samtools view も並列化 | ぼうのブログ

    sayamatcher
    sayamatcher 2016/03/02
    たまに使うときにしょっちゅう忘れるので。備忘録的に
  • 首都圏高速、4月から最短距離で計算へ 都心の渋滞避け圏央道迂回も同料金 (乗りものニュース) - Yahoo!ニュース

    国土交通省は2016年3月1日(火)、首都圏の新たな高速道路料金について、日付で高速道路会社へ事業許可を行ったと発表しました。 新大宮バイパスに敗北 孤立した関越道、その未来は  整備の経緯などから、これまで路線によって異なっていた首都圏の料金体系や車種区分ですが、それを「対距離制」を基とした料金体系に整理、統一し、起終点を基とした“継ぎ目のない料金”を実現するのが大きなポイントです。 これにより、例えば都心部の渋滞を避けて圏央道や外環道を利用した場合に料金面で不利にならないよう、ETC車は経路によらず起終点間の最短距離で料金が決定されるようになります。都心へ向かう場合に外環道を使って迂回しても、外環道利用分は全額割引です。 また、料金水準が「高速自動車国道の大都市近郊区間」のものに統一され、割高な圏央道西側区間などで料金水準が引き下げになります。これによって第三京浜や京葉道路と

    首都圏高速、4月から最短距離で計算へ 都心の渋滞避け圏央道迂回も同料金 (乗りものニュース) - Yahoo!ニュース
    sayamatcher
    sayamatcher 2016/03/02
    “都心の渋滞を避けて遠回りしても料金は最短距離” ほほう