2018年2月20日のブックマーク (8件)

  • ウンシュウミカンの全ゲノムを解読 -カンキツ品種改良の効率化に期待- | 国立遺伝学研究所

    Draft sequencing of the heterozygous diploid genome of Satsuma (Citrus unshiu Marc.) using a hybrid assembly approach Tokurou Shimizu, Yasuhiro Tanizawa, Takako Mochizuki, Hideki Nagasaki, Terutaka Yoshioka, Atsushi Toyoda, Asao Fujiyama, Eli Kaminuma, Yasukazu Nakamura Frontiers in Genetics 05 December 2017 DOI:10.3389/fgene.2017.00180 プレスリリース資料 1.農研機構は情報・システム研究機構国立遺伝学研究所と共同で、ウンシュウミカン「宮川(みやがわ)早生(

    sayamatcher
    sayamatcher 2018/02/20
    “農研機構は情報・システム研究機構国立遺伝学研究所と共同で、ウンシュウミカン「宮川(みやがわ)早生(わせ)」の全ゲノム配列を解読しました。ゲノムの大きさは約3億6000万塩基対でした” #NIG #DDBJ
  • Genomics of the origin and evolution of Citrus - Nature

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    Genomics of the origin and evolution of Citrus - Nature
  • From proposals to snarks: the messages that scientists sneak into their papers

    Hiding personal messages in the small print of academic papers isn’t a good idea.Credit: Alex Timoshkin/EyeEm/Getty To mark St Valentine’s Day, Nature this week published a collection of stories of romance kindled and sealed by science. One describes a science writer who was asked to investigate unusual crystals in a particle collider, and on her arrival there, was surprised by her partner, who pr

    From proposals to snarks: the messages that scientists sneak into their papers
    sayamatcher
    sayamatcher 2018/02/20
    「論文に、プロポーズや不満など個人的なメッセージを忍び込ませるのは止めよう」
  • ChIP-Atlasを使って共局在タンパク質を探す 〜Colocalizationの使い方〜

    ChIP-Atlas は、論文などで報告された ChIP-seq データを閲覧し、利活用するためのウェブサービスです。データ処理の知識やスキルがない方でも簡単に利用できます。データソースは、公開 NGS データレポジトリ (NCBI, EMBL-EBI, DDBJ) に登録されたほぼ全ての ChIP-seq データです。ChIP-Atlas は、九州大学大学院医学研究院発生再生学分野 と ライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS) が共同で開発しています。 今回の動画では、興味のある転写因子を選択し、それとゲノム上で共局在する転写因子候補を検索、つまり、結合部位が類似する転写因子ペアを知ることができる「Colocalization」の使い方を紹介します。 ChIP-Atlasに関する動画はYouTubeの再生リストからもご覧いただけます。 見どころダイジェスト 01:04 1.

    ChIP-Atlasを使って共局在タンパク質を探す 〜Colocalizationの使い方〜
    sayamatcher
    sayamatcher 2018/02/20
    “興味のある転写因子を選択し、それとゲノム上で共局在する転写因子候補を検索、つまり、結合部位が類似する転写因子ペアを知ることができる「Colocalization」の使い方を紹介” #togotv #DBCLS
  • COSMICでがん遺伝子の体細胞変異について調べる

    COSMIC (Catalogue Of Somatic Mutations In Cancer) はがんと関連する体細胞変異の情報を集積したデータベースです。 COSMICでは、expert curation data と systematic screen data の2タイプのデータがあります。前者は COSMIC の専門キュレーターにより、投稿論文の情報をもとに手動で入力されたデータで、がんの原因となる変異が報告されている遺伝子をまとめた Cancer Gene Census (CGC) というプロジェクトで挙げられた遺伝子について詳細な情報を提供しています。一方、後者は大規模なゲノムスクリーニングのデータを報告した論文からアップロードされたデータや、The Cancer Genome Atlas (TCGA) や International Cancer Genome Conso

    COSMICでがん遺伝子の体細胞変異について調べる
    sayamatcher
    sayamatcher 2018/02/20
    “COSMICを使って、遺伝子名で検索してその遺伝子で報告されている変異の情報を調べる方法や、Cancer Browser で組織や腫瘍のタイプを選び、報告されている変異の情報を調べる方法について紹介” #togotv #DBCLS
  • TO、CC、BCCの特徴と違い

    TO(宛先)とは 「TO(宛先)」には、メ-ルを送る相手のメールアドレスを入力します。「TO(宛先)」に指定してメールを送ることは「あなたに送っていますよ」という意思表示です。 「TO(宛先)」に複数名を登録することも可能 「宛先」に複数のメ-ルアドレスを入力すれば、同じメ-ルを一度に送ることができます。次の画像のように、宛先に指定されている全ての受信者(田中学さん、太田恵子さん)が、宛先欄に表示されるメールアドレスを見て、誰がメールを受け取っているのかを確認できます。 CCとは 「CC」とはカーボン・コピー(Carbon Copy)の略です。カーボン・コピーとは、複写の意味です。TO(宛先)がメインの送信先、CCが複写を送りたい相手だと考えると分かりやすいでしょう。「CC」に入力したメールアドレスにも、同じメールが送信されます。 そのため、「確認のために見てくださいね」「念のためにお送り

    TO、CC、BCCの特徴と違い
    sayamatcher
    sayamatcher 2018/02/20
    わかってない人、多い気がする。宛先ではTOに入っているのに、本文にCC◯◯様っておかしいよ、これ以前に
  • iPhoneをクラッシュさせる「爆弾文字列」とは? 送られると多数のアプリが利用不能に

    iPhoneMacApple Watchに、特定の文字を表示するだけでアプリが落ちるバグが見つかりました。 表示しただけでクラッシュしてしまうため、メッセージやチャットなどで問題の文字を送りつけられた場合、いきなりアプリが落ちたうえに、再び起動しても即座に落ちるループに陥る危険があります。

    iPhoneをクラッシュさせる「爆弾文字列」とは? 送られると多数のアプリが利用不能に
  • GENOME REPORT: High-quality genome assemblies of 15 Drosophila species generated using Nanopore sequencing

    sayamatcher
    sayamatcher 2018/02/20
    “High-quality genome assemblies of 15 Drosophila species generated using Nanopore sequencing”