2021年5月27日のブックマーク (4件)

  • UpSet プロット | 複数の集合の関係を視覚化した図

    2018.07.25 複数の集合の関係を視覚化するとき、ベン図の他に UpSet プロットで描いた方がわかりやすい場合がある。UpSet は、R の UpSetR パッケージで描くことができる(Conway et al., 2017)。 ベン図を作成するとき、各集合の要素を、リスト型で与える。 library(UpSetR) prot1 <- c("3U5Z", "3PT6", "1MHT", "1SSO", "1H1J", "1RIY") prot2 <- c("3U5Z", "3PT6", "1MHT", "1T2K") prot3 <- c("1SSO", "1H1J", "2KI2") data <- list(A = prot1, B = prot2, C = prot3) upset(fromList(data), order.by = "freq") References C

    sayamatcher
    sayamatcher 2021/05/27
    “複数の集合の関係を視覚化するとき、ベン図の他に UpSet プロットで描いた方がわかりやすい場合がある。UpSet は、R の UpSetR パッケージで描くことができる”
  • どれを買えばいいんだ…。「今年、多くのMacが大刷新される」というウワサ

    どれを買えばいいんだ…。「今年、多くのMacが大刷新される」というウワサ2021.05.20 11:0028,595 塚直樹 お財布が爆発する。 BloombergがAppleが今後発売するであろう、新しいMac製品に関する予測を伝えています。昨年、「2年かけてMacCPUをIntel製からApple シリコンに移行する」と発表されており、今年も多くの変更があるのでは…と期待されているところですが…。 1. 高性能な新型MacBook Pro(14インチ/16インチ)が出るっぽいまずBloombergは、14インチ/16インチの新しいMacBook Proが早ければ今年の夏にも発売される、としています。これらには、8コアの高性能コアを含む10コアCPUが搭載され、GPU16コア/32コアの2種類があるようです。メモリ容量も現在の16GBから最大64GBにまで拡大されます。現行のM1 M

    どれを買えばいいんだ…。「今年、多くのMacが大刷新される」というウワサ
    sayamatcher
    sayamatcher 2021/05/27
    “Appleが今後発売するであろう、新しいMac製品に関する予測”
  • nbterm - ターミナルで動くJupyter Notebook

    Python機械学習を利用している人であればJupyter Notebookを知らない人はいないでしょう。Webブラウザ上でコードを実行して、結果を確認できるのは便利ですが、何よりWebブラウザ上で操作しなければいけないのが面倒です。 開発者であればWebブラウザよりもターミナル、そう考える方はnbtermを使ってみましょう。 nbtermの使い方 Jupyter Notebookのファイルを読み込んだところです。 Markdownとコードを混在して書けます。 ヘルプです。 筆者環境で試すとカーネルがなく、コードの実行ができませんでした。それさえ解決できれば、コード実行もできるでしょう。Webサーバを立てるまでもなくPythonのコードを実行して結果を試せるというのは、グラフや画像を必要としないコードを試す際に便利そうです。 nbtermはPython製のオープンソース・ソフトウェア(M

    nbterm - ターミナルで動くJupyter Notebook
    sayamatcher
    sayamatcher 2021/05/27
    “。Webブラウザ上でコードを実行して、結果を確認できるのは便利ですが、何よりWebブラウザ上で操作しなければいけないのが面倒です。 開発者であればWebブラウザよりもターミナル、そう考える方はnbtermを” #moongift
  • 「ゲノム編集にしかできないプロダクトを」 プラチナバイオの奥原啓輔氏が語るゲノム編集技術の社会実装 - epiST_journal

    プラチナバイオ株式会社は、国産ゲノム編集技術「Platinum TALEN」を基礎として設立された、広島大学発ベンチャーです。ゲノム編集とは、特定の塩基配列を狙ってDNAを切断し意図的に突然変異を引き起こす技術で、料・エネルギー・病気の治療といった人類の根源的な問題の解決に資することが期待されています。プラチナバイオは産学共創のオープンイノベーションにより、ゲノム編集×デジタル技術の社会実装を通じた国産ゲノム編集技術の開発への貢献を目指しています。記事では創業の経緯や、ゲノム編集技術を通じて実現したい目標についてお話を伺いました。 奥原 啓輔(Keisuke Okuhara) プラチナバイオ株式会社 代表取締役CEO この記事の目次 産学共創プラットフォームの成果のひとつである国産ゲノム編集技術を提供 研究者側とビジネス側、お互いの想いを汲み取り、翻訳して、理解を得る 共創で科学技術

    「ゲノム編集にしかできないプロダクトを」 プラチナバイオの奥原啓輔氏が語るゲノム編集技術の社会実装 - epiST_journal
    sayamatcher
    sayamatcher 2021/05/27
    “プラチナバイオは産学共創のオープンイノベーションにより、ゲノム編集×デジタル技術の社会実装を通じた国産ゲノム編集技術の開発への貢献を目指しています。本記事では創業の経緯や、ゲノム編集技術を通じて実現